赤霉病是由禾谷镰刀菌(Fusarium graminearum)引起的严重危害小麦产量和品质的真菌病害,现已成为我国小麦生产面临的重大限制因素,严重威胁我国的粮食安全和食品安全。鉴定、发掘新的抗赤霉病基因、提高小麦抗病性、培育优良抗性品种是解决小麦赤霉病最经济、最有效的手段。当前,围绕小麦赤霉病抗性关键基因的鉴定及其调控机理研究已开展了大量研究。但在转录后水平、基因调控层次研究小麦对赤霉病菌响应、感受及抗性产生过程中的作用机制还比较少。鉴于此,本研究以RNA编辑为切入点,以3个抗病和1个感病品种为材料,利用RNA-seq技术系对禾谷镰刀菌侵染后的小麦穗部的RNA编辑位点进行了系统鉴定和比较。结果发现,共鉴定到了115个特异的RNA编辑位点,分布在42个基因中。相比于对照,抗性材料中在接种禾谷镰刀菌后发生的RNA编辑位点显著增多,而在感病品种中则较少,暗示RNA编辑可能在抗、感过程中发挥了作用;进一步,对编辑后基因的表达特性进行了分析,发现在接种2天时,有19个基因差异表达,接种4天时有14个基因差异表达,其中3个基因在2天和4天同时发生了编辑和差异表达;最后,对编辑前后的氨基酸变化和蛋白质结构进行预测发现,大多数编辑引起了蛋白质结构的较大变化。其中糖基转移酶基因TraesCS6A01G343100基因在三个抗病品种中都发生了5个相同的编辑,而在感病品种没有编辑发生,并且编辑还引起了蛋白质二级结构的变化,可能是调控小麦抗、感赤霉病的关键候选基因。本研究为从RNA编辑水平阐明小麦感受和响应禾谷镰刀菌侵染的机制提供有用信息,为全面揭示小麦赤霉病抗性机理提供了新的思路。