研究较小(同一栖息地的不同海拔)和较大地理分布区杓兰属植物内生真菌多样性及群落组成。1、采集了四川黄龙沟沿海拔梯度(3 170–3 400m)上4个不同杓兰居群中3种杓兰植物根,利用克隆文库方法获得菌根真菌ITS序列,研究同一栖息地(黄龙沟)不同海拔梯度和不同杓兰对菌根真菌多样性和群落结构的影响。通过培养(菌丝团分离)和非培养(克隆文库)两种方法来得到西藏杓兰菌根真菌(菌根真菌)ITS序列。结果显示,两种方法分别得到15和6个可操作分类单元(operational taxonomic units, OTU),分别隶属于胶膜菌Tulasnellaceae、亡革菌Thelephoraceae和角担菌Ceratobasidiaceae,胶膜菌为优势菌。随着海拔升高,西藏杓兰菌根真菌多样性减少,海拔对其菌根真菌群落结构无显著影响。通过培养方法分离得到278株根相关真菌(RAF),25种OTU类型,包括23个子囊菌门OTU,2个毛霉菌门OTU。随着海拔升高RAF物种丰富度没有显著差异,不同海拔群落分化程度不显著。生态功能分析显示25个OTU包括共生型、腐生型和致病型3种营养型和8种共位群。RAF中狭截盘多毛孢(Truncatella angustata)为优势种(61.9%),在西藏杓兰中为新记录种。2、四川双桥沟不同山上(SC1和SC2)和陕西太白山(TB)采集的三个西藏杓兰居群,比较其根中内生和根际土中真菌多样性和群落结构的差异。结果表明,根中真菌丰度较根际土丰富,四川两个样点根中真菌丰富差异显著,但根际土中差异不显著;四川两个样点根中的真菌群落结构较陕西样点分别有显著差异。共存网络分析显示,根中和根际的核心类群有差异,模块的划分可能与生态类型有关。结论为在小的地理尺度上,不同杓兰对真菌的偏好性较海拔梯度对真菌群落结构的影响大;在较大地理尺度上,同一种杓兰根际土中的真群落对根中真菌群落的影响较大。