基于GHMM的植物poly(A)位点识别模型与算法

来源 :中国系统工程学会第十四届学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户：zjj1993930

【摘要】

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探讨了隐式马尔可夫模型(HMM)在植物poly(A)位点识别中的应用.以拟南芥mRNA poly(A)位点周围序列的核苷分布的特征为基础,应用改进后的向前-向后(forward-backward)算法,构建

【作者】

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吉国力郑健体吴小惠李恒陈金桥

【机构】

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厦门大学自动化系,福建,厦门,361005

【出处】

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中国系统工程学会第十四届学术年会

【发表日期】

：

2006年期

【关键词】

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探讨了隐式马尔可夫模型(HMM)在植物poly(A)位点识别中的应用.以拟南芥mRNA poly(A)位点周围序列的核苷分布的特征为基础,应用改进后的向前-向后(forward-backward)算法,构建并实现了一个基于GHMM(广义隐式马尔可夫模型)的位点识别模型.通过大量的位点识别实验,该模型达到了理想的敏感度和特异度,证明其在生物学应用方面具有很好的可行性和有效性.

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