【摘 要】
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目的：分析食管癌和癌旁组织中circRNA 表达模式,探讨差异表达circRNA 可能的功能.方法：选取3 对手术切除食管癌和癌旁组织RNA 进行去线性化测序,应用配对样本t检验分析食管癌和癌旁组织中circRNA 表达差异(P＜0.05,FoldChange ＞2).针对circRNA接口位点设计引物,并对产物进行PCR 测序验证.选取收集到的经病理验证的食管癌和癌旁组织,分别提取RNA 采用实
【机 构】
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东南大学公共卫生学院环境医学工程教育部重点实验室,江苏 南京 210009
【出 处】
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中国环境诱变剂学会风险评价专业委员会第二十届全国学术交流会议
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目的：分析食管癌和癌旁组织中circRNA 表达模式,探讨差异表达circRNA 可能的功能.方法：选取3 对手术切除食管癌和癌旁组织RNA 进行去线性化测序,应用配对样本t检验分析食管癌和癌旁组织中circRNA 表达差异(P＜0.05,FoldChange ＞2).针对circRNA接口位点设计引物,并对产物进行PCR 测序验证.选取收集到的经病理验证的食管癌和癌旁组织,分别提取RNA 采用实时荧光定量PCR 法检测人群样本中circRNA 差异表达情况.利用circRNA 的来源基因信息,对差异表达circRNA 进行GO 富集和KEGG pathway 分析.结果：食管癌和癌旁组织中存在大量circRNA,这些circRNA 可能与多种miRNA 及mRNA 相互作用.结论：食管癌和癌旁组织中circRNA 表达存在差异,差异表达的circRNA 可能在食管癌进程中发挥重要作用.
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