【摘 要】
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采用同源克隆和RACE等技术,首次成功获得金钱鱼(Scatophagus argus) MHC Ⅰ类α基因与β2m微球蛋白基因的cDNA全序列,并扩增和分析其内含子序列.结果表明,α基因序列全长2020 bp,5UTR为86bp,3UTR为866bp,而开放阅读框(ORE)长1068bp,共编码355个氨基酸,推测分子质量约40.09 kDa,包括前导肽、三个结构域(α1、α2、α3)、跨膜区及胞
【机 构】
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上海海洋大学,水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室,上海201306
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采用同源克隆和RACE等技术,首次成功获得金钱鱼(Scatophagus argus) MHC Ⅰ类α基因与β2m微球蛋白基因的cDNA全序列,并扩增和分析其内含子序列.结果表明,α基因序列全长2020 bp,5UTR为86bp,3UTR为866bp,而开放阅读框(ORE)长1068bp,共编码355个氨基酸,推测分子质量约40.09 kDa,包括前导肽、三个结构域(α1、α2、α3)、跨膜区及胞质区；β2m基因序列全长为905bp,包括90bp的5UTR,467bp的3UTR及351bp的ORF,其中ORF共编码1 16个氨基酸,包含前导肽及成熟的β2m.MHC Ⅰ类分子的二级结构蛋白均为混合型.金钱鱼MHCⅠ类α基因和β2m基因的内含子与外显子的匹配位点均为gt/ag.α基因结构由7个外显子和6个内含子组成,其中内含子4有长度为655bp和691bp的两种类型,内含子6则将3UTR隔开；α2m基因结构由3个外显子和2个内含子组成,这一点与其他物种有高度的保守性.采用Realtime PCR技术检测该基因的表达,发现其在健康金钱鱼10种组织中的表达量上存在差异,α基因在肾和脾等免疫组织中表达量较高,而在与外界环境接触较多的鳃、肌肉,肠等组织中表达较弱,而β2m基因较强表达于肾、脾和肝,中等表达于心、脑、鳃和肠,低表达于胃、眼和肌肉.在NJ法构建的分子系统关系树中,金钱鱼与金头鲷的亲缘关系最近,与鲈、鲑、鳟、鸡、非洲爪蟾、鼠及人类的亲缘关系则渐远.
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