【摘 要】
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SRAP分子标记被广泛用于作物高密度遗传图谱构建、重要农艺性状的基因定位、QTL分析和在没有基因组信息的情况下进行遗传多样性评估.为了将下一代测序技术和SRAP相结合,
【机 构】
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西北农林科技大学农学院,陕西杨凌,712100
【出 处】
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中国作物学会油料作物专业委员会第七次会员代表大会暨学术年会
论文部分内容阅读
SRAP分子标记被广泛用于作物高密度遗传图谱构建、重要农艺性状的基因定位、QTL分析和在没有基因组信息的情况下进行遗传多样性评估.为了将下一代测序技术和SRAP相结合,我们利用Illumina公司的Solexa测序技术对序列标记的SRAP PCR产物进行了测序.结果：三组SRAP引物和三组标记引物先后被用于77568个SRAP PCR反应和77568个标记PCR反应.标记后的PCR产物被混合成一个样用于Solexa测序.测序的结果是一个1.28G的文本文件,其中包含了超过130亿对双末端序列.这些序列被用于寻找对应的SRAP标记和整合到一张超高密度遗传图谱上.该遗传图谱是用属于A基因组的重组自交系群体构建而成,含有465个区段.共包含9177个SRAP标记,1737对Solexa双末端序列和46个SSR标记,代表了10960个独立的遗传位点.其中141个SRAP标记找到了对应的Solexa双末端序列.通过共有的SRAP标记将该遗传图谱和之前发表的油菜超高密度遗传图谱进行了连锁群对应.此外,还通过SSR标记将该图谱与其他5张白菜或油菜的遗传图谱进行了连锁群对应.结论：我们用SRAP标记在A基因组中构建了一张包含了10960个独立位点的超高密度遗传图谱,这是在该物种中构建的饱和度最高的遗传图谱.通过第二代测序技术,我们将1878条Solexa序列整合到该遗传图谱上.这些整合的序列可用于A基因组scaffold的组装.该遗传图谱将被用于白菜和油菜的基因克隆和分子标记开发.
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