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用限制性片段长度多态性（Restriction fragment length polymorphism，RFLP）方法研究了在农业废物堆肥一次发酵和二次发酵期间添加黄孢原毛平革菌（P. chrysosporium）对微生物多样性的影响。结果表明，在不同发酵期接种P. chrysosporium对堆肥进程的影响不同。三种典型的限制性内切酶Alu I、Hae III和Taq I在分析堆肥细菌微生物多样性的灵敏性上，Hae III效果最好，Alu I次之，Taq I则不是很适用于分析堆肥细菌微生物多样性。接种黄孢对堆肥细菌群落的影响非常显著且迅速，二次接种起到巩固一次接种效果的作用。