【摘 要】
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参照红斑丹毒丝菌表面抗原A(spaA)基因的核苷酸序列合成一对引物，对我国生产用红斑丹毒丝菌CVCC43005的SpaA全基因进行了PCR扩增，扩增产物连接到pMD18-T载体上，进行序列测定
【机 构】
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中国兽医药品监察所,北京100081
【出 处】
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第三届全国微生物资源学术暨国家微生物资源平台运行服务研讨会
论文部分内容阅读
参照红斑丹毒丝菌表面抗原A(spaA)基因的核苷酸序列合成一对引物，对我国生产用红斑丹毒丝菌CVCC43005的SpaA全基因进行了PCR扩增，扩增产物连接到pMD18-T载体上，进行序列测定和分析.结果表明，SpaA基因全长1881 bp，含有1个开放性阅读框，编码626个氨基酸。与已提交的红斑丹毒丝菌血清型1a、1b，2a、2b、5、8、9、12、15、16、17、和N型的氨基酸同源性为97.5%-100％，血清型4、6、11、19、21的氨基酸同源性为52.8％-55.2％。与已提交的丹毒丝菌血清型18的氨基酸同源性为57.5％-58.0％。采用Chou-Fasman和Karplus-Schulz方案预测蛋白质的二级结构和柔性区域；运用Kyte-Doolittle方案预测氨基酸的亲水性，按Jameson-Wolf方案预测抗原指数，利用Emini方案预测蛋白质的表面可及性.对预测结果综合分析，推测最有可能的B细胞表位位于N端的59-64，85-91，174-186，193-201，212-215，221-231，266-275，278-288，291-308，314-327，329-349，356-376，403-456，508-516，528-537，568-576和607～626。
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