基于转录组测序的黄曲霉对5-氮杂胞苷应答机制研究

来源 :第四届全国微生物基因组学学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jjjuuu52107
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  本研究应用RNA测序技术,尝试通过全面获取黄曲霉对5-AC应答的转录组信息,期望对5-AC作用机理能有更深入的理解。在5-AC处理和非处理两个样品中,总共获得近5G的测序数据,其中近89.95%可以匹配到黄曲霉基因组上。分析结果发现,5-AC处理后的黄曲霉,仅有240个基因发生了显著差异表达(q值<0.05),其中114个基因发生表达上调,116个基因发生表达下称显著差异表达的基因主要涉及丝氨酸蛋白酶的活性。在黄曲霉的55个次级代谢基因簇中,仅有编码一种非核糖体多肚的第35个基因簇的表达受到5-AC的显著影响。在AF生物合成基因簇的34个基因中,有超过四分之三的基因在5-AC处理之后发生了不同程度的表达下调。此外,其他次生代谢基因簇中多个基因也发生了不同程度的改变。多个涉及真菌发育的基因的表达也发生了显著的改变,包括编码veA蛋白的veA基因,这一蛋白在负责真菌次生代谢和生长发育共调控机制的三聚体蛋白velvet复合物Ve1B/VeA/LaeA中起着连接另外两个蛋白的作用。推测,5-AC可能通过某种机制,抑制了VeA的表达,使黄曲霉体内VeA蛋白浓度降低,减弱甚至阻断Ve1B和LaeA蛋白之间的连接,从而使黄曲霉的生长发育和次级代谢出现紊乱,诱导其产生白色绒毛状表型,并抑制AF的生物合成。与此同时,利用该RNA测序数据,完善了黄曲霉基因组注释,并发现了黄曲霉中的选择性剪接现象。
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