名贵茶花种质资源的RAPD分析

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本研究选取具有一定的地理代表性、观赏价值极高的名贵茶花品种为试材,摸索适合茶花基因组DNA的提取方法,筛选用于种质鉴定的合适引物并构建指纹图谱,同时进行种质资源遗传多态性、亲缘关系的分析,探讨了RAPD用于茶花品种资源分析的可行性,获得了以下结果: 1.采用改进的CTAB法抽提茶花基因组DNA,研磨时加入了适量PVP粉末,在2%的CTAB抽提液中临时加入了1%β-巯基乙醇,以防止了酚氧化成醌,避免了褐变;用CTAB/NaCl溶液去除多糖等措施,经A260和A280比值的测定,以及电泳检测和PCR扩增,结果表明改进的CTAB法所提取的DNA无论在纯度上还是在在完整性上都比其它方法要好。 2.用正交设计法建立了茶花RAPD-PCR扩增体系:反应总体积25μl,模板DNA80ng,10碱基随机引物的浓度为0.3μmol/L,dNTPs的浓度为0.2 mmol/L,MgCl2的浓度为2mmol/L,Taq-DNA聚合酶1U。PCR扩增程序为:94℃预变性5 min,94℃变性50s,36℃退火50s,72℃延伸90s,共40个循环,最后72℃延伸8min。 3.从100个随机引物中筛选出的20个有效引物共产生136条DNA片段,大小分布在0.25~2.0Kb之间,遗传多态性带120条占总数88.2%,每个引物扩增的DNA带数平均为6.8条。23个茶花品种的遗传相似性分析表明,各基因型间的Nei氏相似系数分布在0.4386~0.8936之间,平均相似性系数为0.7668。 4.通过非加权算术平均数聚类(UPGMA)法,绘制了23个茶花品种的遗传关系树状图。当以相似系数0.75为分割线时,23个品种可划分为4个类群。类群A为‘白尼姑’、‘花展时节’、‘波谱’;类群B为‘拉拉罗克’、‘香神’、‘南斑柯’、‘南极星’、‘樱桃节’、‘红台阁’、‘烈香’、‘凡丽’、‘贞洁’、‘惠勒’、‘红绒贝蒂’、‘达婷’、‘高帽子’、‘塔莉尔小姐’、‘复色明天’、‘秋牡丹’、‘魔术城’、‘凯蒂’;类群C为‘哈罗德’;类群D为‘春节’。RAPD分析结果与传统分类学结果基本相符。 5.用引物SBS-X5,SBS-X6和SBS-S15扩增的12条多态性条带构建了23个茶花品种的DNA指纹图谱,可用于茶花的种质鉴定。 6.实验发现,茶花株型紧凑这一性状可能与RAPD特异标记SBS-S15-1000片段上的某些基因连锁。
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