葡萄（Vitis vinifera）是世界上最古老的栽培果树之一,与苹果、柑桔和香蕉并列为世界四大水果,但同时也是最易遭受病毒侵害的果树之一,病毒会严重影响葡萄产量与品质,近年来内蒙古自治区设施葡萄和露地葡萄种植面积呈不断扩大的趋势,为了解内蒙古自治区葡萄病毒种类及其分离物株系归类,本研究使用常规RT-PCR法对采自区内7个市区的69份葡萄样品进行14种葡萄病毒检测,结果显示共检测到9种葡萄病毒,检出率分别是GFab V为8.7%（6/69）、GFk V为68.1%（47/69）、GINV为7.2%（5/69）、GLRa V-2为2.9%（2/69）、GLRa V-3为39.1%（27/69）、GPGV为23.2%（16/69）、GRSPa V为63.8%（44/69）、GVB为2.9%（2/69）和GVE为5.8%（4/69）,这些病毒均可与其他病毒复合侵染植株。序列分析表明:各病毒内蒙古分离物有效序列在进化树分布分为以下两种规律,第一种是GFab V、GLRa V-2、GVB和GVE的内蒙古分离物有效序列均处于同一进化分支上,属于同一群组;第二种是GFk V、GINV、GLRa V-3、GPGV和GRSPa V的内蒙古分离物有效序列处于两个或以上进化分支上,属于多个群组,同时第二种葡萄病毒都存在同一分离物的不同有效序列分布于不同进化分支的情况;并且9种病毒内蒙古分离物有效序列都没有表现地理来源特异性。核苷酸一致性分析显示,各病毒内蒙古分离物有效序列与对应参考序列核苷酸一致性范围差异较大。葡萄灰比诺病毒（Grapevine Pinot gris virus,GPGV）2012年首次在意大利特伦蒂诺地区发现,目前在除南极洲以外的六大洲均有报道,GPGV是发生最普遍、危害最严重的葡萄病毒之一,Michel等人通过系统发育和遗传多样性分析认为中国可能是GPGV起源国,我国目前仅报道了一个GPGV全基因组,本研究为丰富中国葡萄GPGV全基因组种群信息并明确其分类地位,从上述鉴定GPGV为阳性的葡萄样品中进行GPGV内蒙古分离物全基因组克隆,得到两个GPGV内蒙古分离物全基因组序列分别命名为GPGV1 Inner Mongolia和GPGV3Inner Mongolia,基因组结构与其他已知GPGV分离物相似,序列分析表明:这两个GPGV内蒙古分离物全基因组均未发生重组事件;与其他已知GPGV分离物核苷酸一致性较低;以全基因组、Rd Rp和MP构建的进化树来看,两个GPGV内蒙古分离物与中国先前报道的GPGV分离物属于同一独立亚组,具有特殊分类地位,以CP构建的进化树来看,GPGV3 Inner Mongolia与中国先前报道的GPGV分离物和其他绝大部分GPGV分离物属于同一亚组,而GPGV1 Inner Mongolia独立形成一个亚组。