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蛋鸭的产蛋性能是衡量其经济价值的重要指标,主要包括开产日龄、产蛋量、蛋品质等性状。通过科学技术手段,找到影响蛋鸭产蛋性能的候选基因,通过分子标记辅助育种技术,能够显著提高其产蛋性能。全基因组关联分析(GWAS)即通过重测序在全基因组范围内找出与目标性状相关联的候选区域及基因。本实验共分两部分,第一部分是选取绍兴鸭、山麻鸭、攸县麻鸭和缙云麻鸭四个优良蛋鸭品种各1600只,从开产日龄之日起,每天记录其产蛋量,直至66周龄,并在299日龄、300日龄和301日龄时,每个品种各随机选择30个鸭蛋进行蛋品质测定,最后通过统计学分析四个蛋鸭品种的产蛋性能的差异性。第二部分是在1600只绍兴鸭中随机选择300只作为全基因组关联分析的实验对象,开产日龄和产蛋量数据记录同上,蛋品质测定为在299日龄、300日龄和301日龄,对300只蛋鸭的鸭蛋全部进行测定,在实验过程中除去蛋品质测定只有一天的及死淘的蛋鸭,在实验末期进行血样采集,提取基因组DNA,经过检测所提取到的基因组DNA的完整性、纯度及浓度,最终合格样品有166个进行重测序,然后对绍兴鸭产蛋性状的11项指标进行全基因组关联分析,筛选候选基因,为今后优质蛋鸭新品种选育提供理论支撑。1.利用IBM SPSS Statistics 21.0软件对四个蛋鸭品种的开产日龄、不同周龄的产蛋量及蛋品质分别进行单因素方差分析,用LSD的方法分析各项指标之间的差异性,及通过相关性分析分析各项指标之间存在的相关性。四个品种中绍兴鸭的蛋重(66.46±0.79g)、蛋黄色度(13.20±0.18)、蛋壳强度(4.42±0.21)均显著高于缙云麻鸭(P<0.05),蛋壳强度极显著高于山麻鸭(P<0.01),蛋壳厚度极显著高于其它三个品种(P<0.01),总蛋重(17.72±0.21kg)极显著高于缙云麻鸭和和山麻鸭(P<0.01);另外开产日龄和产蛋量的差异性比较结果为绍兴鸭开产日龄最晚,但是其66周龄时总蛋重为最高,而攸县麻鸭开产日龄最早,但其66周龄时产蛋量和总蛋重均为最低,说明绍兴鸭开产日龄虽晚,但产蛋持续时间及产蛋率高,攸县麻鸭开产日龄早,但存在早衰的现象。2.通过重测序对绍兴鸭开产日龄、产蛋量及蛋品质进行全基因组关联分析,在全基因组范围内共检测到10个与产蛋性状显著关联的SNPs,其中有4个SNPs与开产日龄显著关联、6个SNPs与66周龄产蛋量显著关联。与开产日龄显著关联的SNPs均位于2号染色体,其中一个SNP位点位于MARCHF6基因内,另外三个SNPs位点均位于MARCHF6基因上游2～4kb处;在2号染色体上还有4个SNPs与66周龄产蛋量显著相关,且均位于CA2和ATP6V0D2基因之间,在29号染色体上,有2个SNPs与66周龄产蛋量显著相关,分别位于WDR18基因上游1kb处和GRIN3B基因下游75bp处。在这些位点附近共找到MARCHF6、CA2、WDR18、GRIN3B等候选基因。对于蛋品质指标并未关联到显著SNP。