对比PCR-SSCP与目标序列捕获二代测序在TSC-RAML诊断中的应用价值

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V目的通过分析结节性硬化症相关的肾血管平滑肌脂肪瘤(Tuberous Sclerosis Complex-Renal Angiomyolipoma,TSC-RAML)患者的聚合酶链式反应-单链构象多态性(Polymerase Chain Reaction-Single-Strand Conformation Polymorphism,PCRSSCP)和二代测序(Next-generation Sequencing,NGS)的检测结果,及不同基因型患者临床表型的特点,探讨两种检测方法在TSC-RAML基因诊断中的应用价值,为今后临床决策和研究提供参考。方法同时使用PCR-SSCP和目标序列捕获NGS检测25例TSC-RAML患者的致病性基因TSC1和TSC2,对比PCR-SSCP和NGS对TSC-RAML基因诊断的准确率。根据准确度较高检测方法的检测结果将患者分组,对比各组患者一般情况与临床表型的差异,验证临床表型与基因型是否相符。结果(1)24例患者,PCR-SSCP检测出18例有突变,NGS检测出9例有突变,PCR-SSCP突变检出率明显高于NGS,差异有统计学意义(P<0.05)。PCR-SSCP和NGS检测结果一致的有3例,其比例明显低于不一致的21例患者,差异有统计学意义(P<0.05)。PCR-SSCP检测有突变的18例患者的NGS突变检出率反而低于PCR-SSCP检测无突变的6例患者(33.3%与66.6%),但差异无统计学意义。所有NGS检测出的突变均进行Sanger测序验证,二者结果完全一致(2)TSC1/2突变组与非TSC1/2突变组,在年龄与性别分布情况的差异均无统计学意义(P<0.05)。TSC1/2突变组面部血管纤维腺瘤或前额斑块、色素脱失斑的出现频率均明显高于非TSC1/2突变组,差异均有统计学意义(均P<0.05)。两组患者牙釉质点状凹陷、指(趾)甲纤维瘤和骨骼病变的出现频率,TSC1/2突变组均高于非TSC1/2突变组,但差异无统计学意义(均P>0.05)。两组患者鲨革斑、皮质结节、室管膜下结节(Subependymal Nodules,SEN)、室管膜下巨细胞星形细胞瘤(Subependymal Giant cell Astrocytoma,SEGA)、非肾脏错构瘤或多发性肾囊肿的出现频率,均无统计学差异(均P>0.05)。两组患者RAML相关症状和体征,TSC1/2突变组出现频率明显高于非TSC1/2突变组,出现时年龄TSC1/2突变组也明显较非TSC1/2突变组年轻,差异均有统计学意义(均P<0.05)。TSC1/2突变组患者的最大体积RAML直径显著大于非TSC1/2突变组,差异有统计学意义(P<0.05)。TSC1/2突变组患者RAML分级大于3级的比例明显高于非TSC1/2突变组,RAML分级不超过3级的比例明显低于非TSC1/2突变组,差异均有统计学意义(均P<0.05)。两组患者RAML破裂大出血发生率在随访期间无统计学差异(P<0.05)。结论(1)PCR-SSCP检测TSC-RAML患者的的致病性基因TSC1和TSC2不可靠,而且PCR-SSCP筛查也不能提高NGS的突变检出率,不建议临床推广使用。(2)NGS检测TSC-RAML患者的致病性基因TSC1和TSC2准确可靠,TSC-RAML患者的临床表型也基本符合NGS检测出的基因型。(3)NGS未检测出突变的TSC-RAML患者一般临床表现相对较轻,部分患者可能具有遗传镶嵌现象,有待于进一步研究。
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