亚洲栽培稻是由普通野生稻驯化而来,从早前分布于南亚、东南亚、中国南部地区至今广泛分布于世界各地。提高水稻产量是目前育种研究最主要的目的之一,因此我们需要选择抽穗期适中的品种以适应我国广幅生态环境。由于水稻对不同生境的适应性差异,造成其从普通野生稻进化成抽穗期具有明显差异的两个亚种。对开花时间的详细研究将有助于揭示栽培稻抽穗期的适应性机制,为培育适应不同光温环境的栽培品种提供理论基础及材料资源。本研究主要收集四个长日照抑制途经的基因Hd1、DTH8、Ghd7和OsPRR37,并对154、74、69和62个品种进行测序。在长日照条件下,具有非功能型等位基因的品种比具有功能型等位基因的品种明显更早开花。然而这四个基因在调控开花路径上具有不同的遗传效应,Hd1和OsPRR37是调控所有水稻品种开花时间的主效基因,而DTH8和Ghd7仅调节地方品种开花时间。亲缘地理学分析结果显示这些具有区域适应性的抑制性位点的非功能型等位是近年独立进化而来。这些具有区域适应性的等位可以应用于遗传改良种,丰富的遗传变异,可以为培育适应不同环境的具有不同抽穗期的品种提供材料资源。