近年来,中国东南沿海频繁发生球形棕囊藻（Phaeocystis globosa）藻华,严重危害沿海生态系统和海水养殖安全,甚至由于球形棕囊藻囊体堵塞核电站冷凝水系统,造成核电安全隐患。关于中国东南沿海球形棕囊藻的形态和分子特征的研究仍然较缺乏,其起源问题仍存在争议。球形棕囊藻的分类学和生活史研究中仍存在诸多问题有待解决。因此,本文选取广东汕头（SC1）、海南（SC2）、广东珠海（SC3）、广西（SC4）、广东茂名（SC5）、广东湛江（SC6）、福建（EC7）和墨西哥湾流海域（CCMP629）的8个具有代表性的球形棕囊藻地理株系为研究对象,进行该种的形态特征研究、系统发育学分析以及生活史过程的研究,并与其它地理株系进行比较。通过光学显微镜、扫描电镜和透射电镜观察发现,本文研究的8个株系在形态上都基本符合球形棕囊藻的特征,8个株系中都观察到三种类型的细胞:小型鞭毛细胞、大型鞭毛细胞和囊体细胞,但这8个株系在相同类型细胞的鞭毛长度、细胞大小及小型鞭毛的分泌物有无和胞外附属物等性状中存在差异,表明中国东南沿海球形棕囊藻形态具有多样性。与欧洲沿海球形棕囊藻株系形态相比,这8个株系具有以下特征:小型鞭毛细胞和大型鞭毛细胞两根鞭毛稍不等长（比值为1.1-1.5）;株系SC5和SC6小型鞭毛细胞鳞片上覆盖圆环形丝状物物质,另外6个株系中未观察到鳞片;除株系SC4和EC7外,另外6个株系囊体细胞较小。尽管这些特征并不稳定,但也暗示中国东南沿海球形棕囊藻株系与欧洲沿海株系存在的差异。球形棕囊藻的小型鞭毛细胞定鞭体与鞭毛长度比值相对稳定,区别于棕囊藻属的其它物种,可作为棕囊藻属分类鉴定的参考特征。本文利用核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶大亚基（rbc L）、核糖体16S、18S、ITS1的DNA序列对本研究中的8个株系和从Gen Bank引用序列进行系统发育分析。结果证明这8个株系属于球形棕囊藻。棕囊藻rbc L和16S序列相对比较保守,但有鉴定物种的潜力;ITS1序列非常高变,同一株系中也出现多个ITS1序列拷贝;18S r DNA序列对棕囊藻属下物种的鉴定较合适。18S和ITS1 r DNA序列系统发育分析结果表明球形棕囊藻是一个复合种,至少存在暖水亚型和冷水亚型;暖水型株系ITS1序列的多态性暗示隐存种仍然能杂交,中国东南沿海球形棕囊藻株系可能是复合种群,由多个地理株系杂交形成。本文通过光学显微镜、扫描电镜观察以及流式细胞术检测细胞周期,对中国东南沿海球形棕囊藻的生活史过程进行了研究。结果表明,中国东南沿海球形棕囊藻的生活史过程与已报道的球形棕囊藻生活史过程基本相符,但也观察到更多的阶段。中国东南沿海球形棕囊藻能以多个途径形成囊体,有利于生活史中囊体阶段形成绝对优势。此外,本文研究记录了囊体细胞向大型鞭毛细胞、小型鞭毛细胞的转换,小型鞭毛细胞的分裂,以及不动细胞附着在窄隙角毛藻表面形成的聚集体（aggregates,AAs）。在球形棕囊藻中,这种聚集体和囊体细胞的减数分裂首次以显微照片的形式记录。流式细胞术结果表明大型鞭毛细胞与囊体细胞均为二倍体,可能还存在单倍体的小型鞭毛细胞,本研究的8个株系的绝大多数游离单细胞为二倍体。综上,本文研究了关于中国东南沿海球形棕囊藻的详细的形态、分子和生活史的特征,研究结果丰富了球形棕囊藻生活史全貌,反映了中国东南沿海球形棕囊藻株系与欧洲沿海株系在形态和分子特征上的差异,提供了球形棕囊藻的隐存种信息。本研究为棕囊藻属的分类学及藻华成因的研究提供了参考资料,并为藻华的监测、治理提供科学理论基础。