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笃斯越桔(Vaccinium uliginosum L.)为杜鹃花科(Ericaceae)越桔属(Vaccinium)多年生落叶灌木或小灌木,果实中花青苷、黄酮醇苷等成分含量高于常见果蔬,具有突出的抗氧化活性。本研究以采自不同野生居群的40个笃斯越桔样本为材料,PCR扩增叶绿体matK和rbcL基因片段,进行序列比对并进行单倍型分析,探讨两个基因片段应用于笃斯越桔遗传多样性分析的可行性,结果表明:1.设计并合成了两对DNA条形码引物,以来自不同野生居群笃斯越桔的40个样本为材料,进行PCR扩增,40个笃斯越桔样本matK序列测序片段长度均为883bp,rbcL序列测序片段长度均为599bp,与GeneBank查阅到的笃斯越桔同源一致性达到99%,说明成功地克隆了笃斯越桔matK和rbcL基因片段。2.40个笃斯越桔matK序列中发现16个变异位点和8个潜在的简约信息位点,可划分为15个单倍型,序列平均的核苷酸多样性为0.00357,平均单倍型多样性为0.8551,各居群的Hd值介0.400-1.000,其中位于长白山东方红林场的N居群单倍型多样性最高,为1.000,H2单倍型在单个居群的5个样本占比最大,为80%,H2单倍型在不同居群的40个样本中占比最高,达到27.5%,说明H2单倍型在居群内和居群间均有较高的占比。3.40个笃斯越桔rbcL序列中发现5个变异位点和2个潜在的简约信息位点,可划分为7个单倍型,平均的核苷酸多样度为0.00095,平均单倍型多样性为0.465,各居群的Hd值介于0.000-0.700,其中位于汪清兰家林场的S居群的单倍型多样性最高,为0.700,H1单倍型在N居群和P居群中占比100%,H1单倍型在8个居群中均有分布,H1单倍型在不同居群的40个样本中占比最高,达到70%,说明H1单倍型在居群内和居群间均有较高的占比。4.对于DNA序列的研究,通常是用单倍型个数、核苷酸多样性和单倍型多样性来衡量群体的遗传多样性。综合分析表明笃斯越桔遗传多样性处于较低水平,本试验中笃斯越桔matK序列的遗传多样性较高,rbcL序列的遗传多样性较低,因此得出matK序列更适合笃斯越桔种质资源的遗传多样性研究。