草莓ARF基因家族启动子预测及ARF4启动子的转录活性分析

来源 :沈阳农业大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:mucao_xkhl
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ARF4是植物响应生长素的转录因子,在植物生长发育过程中起着重要作用。目前关于ARF基因启动子的研究较少,并且在草莓中的研究还尚属空白。本研究利用生物信息学技术,预测草莓ARF基因家族启动子的顺式作用元件,推测其基因的功能,并克隆草莓ARF4基因启动子序列,将ARF4基因启动子与GUS报告基因构建为融合基因,通过不同处理来分析ARF4基因启动子的转录活性,为全面揭示ARF4基因功能奠定基础。主要结果如下:1.从草莓基因组网站中获得了9条ARF基因启动子序列,明确了其在草莓基因组中的具体位置。生物信息学分析显示,它们不仅包含了核心作用元件,还含有大量的与光响应、胁迫响应、激素响应及生理机制调控等相关的顺式作用元件。ARF基因家族不同成员之间作用元件的数量和种类存在差异,不同成员间除包含自己特有的元件外,还存在一些共有的元件。2.从‘艳丽’草莓中克隆获得ARF4基因启动子序列。利用生物信息学在线软件分析该序列发现,该启动子不仅含有TATA-box、CAAT-box,还存在多种顺式作用元件,如光响应元件sp1、Box 4等,厌氧诱导元件ARE,真菌诱导子响应元件Box-W1,蛋白代谢调节作用元件O2-site,赤霉素应答元件P-box等。在草莓栽培品种‘全明星’、‘甜查理’、‘阿尔比’和‘红颜’中都克隆了ARF4基因启动子序列,序列间未发现作用元件存在差异。3.以pRI 201-AN-GUS为基础载体,将ARF4基因启动子连接到该载体上,获得草莓ARF4基因启动子融合载体,命名为proARF4::GUS。利用农杆菌介导的叶盘转化法,以森林草莓‘Ruegen’为材料,获得了5株转proARF4::GUS基因植株。利用农杆菌侵花的转化方法对拟南芥进行遗传转化,获得5株转基因植株。4.将ARF4基因启动子进行分段缺失克隆,分别构建融合载体proARF4A::GUS、proARF4B::GUS,利用农杆菌介导的果实注射法,注射后通过GUS组织染色检测发现,随着启动子序列长度逐渐变短,proARF4B所驱动的GUS基因的表达最弱。5.对转proARF4::GUS基因草莓植株进行了GUS组织染色,发现在叶柄、嫩叶及新茎中GUS表达水平较高,在嫩叶中表达量最高。利用qRT-PCR方法分析了低温、干旱、NaCl、不同激素种类、不同浓度等处理对转基因植株中GUS基因表达的影响,结果表明在低温、干旱及NaCl处理下,GUS基因的表达量影响不大;与IBA等其他激素相比,IAA能明显提高GUS基因的表达量。进一步研究发现在10μmol·L-1 IAA处理12h下GUS基因的表达量最高。
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