创新对社会、经济的可持续发展起着至关重要的作用,是一个企业长远健康发展的核心竞争力。有企业作为我民经济的重要主体,本应成为引领家创新发展的排头兵,但却因为其产权性质的特殊性,在政策性目标和社会责任驱使下,其日常运作往往被政府干预,导致其经营目标遭到扭曲,从而运作效率低下,抑制了创新。现阶段,我推动新一轮的有企业改革,推进政府权力下放,即有企业股权控制链深度增加,这授予有企业更多的自主经营权,促进其市场化运作,并将促进企创新作为改革的重要目标。在深化企改革的背景之下,现有股权控制链结构是否会对有企业创新产生影响?若产生影响,是正向效应还是负向效应?影响机制是怎样的?影响效应是否会因为行业性质、终极控股权性质的不同而产生差异?在探索企改革背景下企创新转型道路的过程中,对于这些问题的解答显得尤为重要。本文首先对股权控制链结构与企业创新、股权控制链结构与两权分离度、两权分离度与企业创新等文献进行回顾与梳理;其次,以委托代理理论、信息不对称理论、社会网络理论为理论基础,分析了股权控制链结构对有企业创新的影响效应及其影响机制;接下来以2009-2020年A股有上市公司为研究对象,构建多元回归的固定效应模型,实证检验控制链结构对有企业创新的影响效应,运用中介效应模型分析两权分离度在控制链结构影响有企业创新过程中的中介作用,并通过分组回归进一步研究了控制链结构对有企业创新的影响效应是否会随行业、终极控股权性质的不同而产生差异;最后,根据实证结果得出了如下结论:（1）股权控制链深度与广度的增加能够有效提升有企业创新投和创新产出水平;（2）股权控制链深度与广度主要是通过增加两权分离度来促进企创新的;（3）终极控股权性质不同也会影响股权控制链结构与有企业创新两者之间的关系,其中地方市级有企业股权控制链结构与企业创新之间不存在简单的线性关系,而是“U”型关系。（4）不同行业分类情况下,高新制造业有企业股权控制链深度和广度的增加能够对企业创新起到更明显的正向促进作用。据此,提出如下建议:（1）政府应当继续推进有企业混合所有制改革,合理安排各级有企业股权结构,应该充分考虑各层级属性有企业差异性。（2）合理安排股权控制链结构的两权分离度。（3）进一步深化混合所有制改革应当更加关注高新制造业企业。