三倍体无籽西瓜食用方便、含糖量高、口感好、抗病、耐涝、耐贮运、丰产稳产、经济效益好，备受人们喜爱，但商品无籽果实中着色秕籽时有出现。本研究以10个二倍体西瓜自交纯系：S279、S555-2、S578、S608、S660、S762、DK7、S216B、A107、Cr和6个四倍体西瓜自交纯系TS279、TS555-2、TS578、TS608、TS660、TS762为材料，采用不完全双列杂交设计，研究了供试材料间亲缘关系、杂交组合间母本、生长势等对三倍体西瓜F1代着色秕籽的影响，分析了三倍体西瓜果实相关性状的配合力及遗传率。以三倍体无籽西瓜品系VS8-27、VS8-45为材料，用二倍体西瓜自交纯系S279、S660、TS33为花粉供体，对两个品系的不同节位雌花授粉坐瓜，研究授粉材料和坐瓜节位对三倍体无籽西瓜着色秕籽的影响。以6个四倍体西瓜纯系TS279、TS555-2、TS578、TS608、TS660、TS762为材料互为父母本杂交、自交配制36个组合，考察相同亲缘关系的三倍体西瓜和四倍体西瓜的着色秕籽的相关性。同时，以四倍体西瓜纯系TS682、TS542为材料配制P1、P2、B1、B2、F1、F2六个世代，研究分析了单果重、单瓜可育种子数、单瓜着色秕籽率的遗传模型。研究结果表明：1父母本亲缘关系远近与三倍体无籽西瓜F1代的单瓜着色秕籽显著相关，但无显著线性相关，父本和母本、父母本组合与三倍体无籽西瓜F1的单瓜着色秕籽显著相关，其中有TS660、S660材料参与的杂交组合的着色秕籽最多，差异显著。所有杂交组合的生长势与着色秕籽极显著负相关。因子分析认为三倍体生长势指数、三倍体中心折光糖含量和三倍体果皮厚对三倍体西瓜着色秕籽影响较大，获得的综合主成分模型F=0.35X1-0.13X2+0.08X3-0.15X4+0.2X5+0.08X6可以计算综合主成分值F，F值大于0的杂交组合较为适宜。当F＞0时，含有10粒以上着色秕籽的组合仅占5%，杂交组合平均着色秕籽2.03粒。2三倍体无籽西瓜的着色秕籽数与二倍体授粉品种、坐瓜节位显著相关，与授粉品种种子大小无关，坐瓜节位低的着色秕籽多。本试验中，三倍体无籽西瓜单果重和授粉品种无显著相关，坐瓜以主、侧蔓第三雌花留瓜较好。3三倍体西瓜的单瓜重、果皮厚、边部折光糖和中心折光糖、着色秕籽性状的一般配合力基因型方差和特殊配合力方差分别为96.43%和3.57%、98.01%和1.99%、95.05%和4.95%、97.77%和2.23%、84.26%和15.74。普通西瓜中，综合性状一般配合力最高的是S578、TS762，着色秕籽一般配合力最小的是S555-2、TS762。单瓜重、果皮厚、边部折光糖和中心折光糖、着色秕籽的广义遗传率和狭义遗传率分别是54.76%和54.62%、80.95%和76.03%、80.95%和76.03%、49.64%和49.11%、68.24%和67.83%、51.99%和23.34%。4主基因多基因混合遗传模型分析结果认为：四倍体西瓜单果重、单瓜可育种子数、单瓜着色秕籽率的最优模型分别为两对加性-显性-上位性主基因+加性-显性-上位性多基因模型（E-0）、两对加性-显性-上位性主基因+加性-显性-上位性多基因模型（E-0）、两对加性-显性-上位性主基因+加性-显性多基因模型（E-1）。