重大科技项目是政府在若干重点领域集中突破，实现科技创新的局部跨越式发展的重要举措，也是合理配置科技资源的重要手段，它不但具有一般项目风险大的特点，还具有创新性的特点。科技管理的理论和实践都表明，众多重大科技项目失败的原因除了技术实力之外，其管理也占有极大的比重。随着我国经济体制改革和产业结构调整的不断深入，科技系统政府职能的转变已是大势所趋。近年来，国家对重大科技项目的监管，从理论到实践都还处在一个探索的阶段，没有可供遵循的固定模式。基于此，中央和地方两级监管机构的监管工作尚未形成统一的规范，监管工作开展的方式多种多样，在一定程度上弱化了监管效能。因此有必要对重大科技项目的监管模式做理论高度的总结，从而给监管的实践工作提供参考的依据。　　政府直接参与科技资源的分配，强化了导向功能，却成了科技成果产业化的潜在障碍。因此以间接管理取代直接管理，是市场经济前提下国家科技管理方式的必然选择，而重大科技项目的监管则是主要的间接管理手段。通过重大科技项目监管，达到政府宏观调控、干预科技资源配置的目的，同时又不直接参与市场竞争，真正实现政府职能的转换。重大科技项目引导了政府科技资金的投向，同时也体现了政策取向，检验了宏观科技政策的实施效果，因此也将直接影响国家宏观科技战略的成败。在新的经济体制下，重大科技项目的实施有不同于以往的新规律，政府管理项目同样要遵循新的经济规律，这就要求我们必须研究在新经济体制下重大科技项目的监管模式。　　本文以研究我国科技重大项目的监管问题为中心，通过借鉴相关理论成果和国内外实践中的先进经验，对现行的监管体系进行全面梳理和评估，通过定性和定量分析，构建科学性、规范化和可操作性的监管体系，并以重庆为例进行实证分析，提出有针对性的对策建议，为科技重大项目的监管提供理论支撑和决策参考。