【摘 要】
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高通量测序技术的出现为从整体水平上了解一个物种或特殊组织器官的基因转录情况成为可能,并且目前已经成为研究缺乏基因组信息物种mRNA的主流技术;同时,也为这些物种的功能
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高通量测序技术的出现为从整体水平上了解一个物种或特殊组织器官的基因转录情况成为可能,并且目前已经成为研究缺乏基因组信息物种mRNA的主流技术;同时,也为这些物种的功能基因的快速鉴定提供了一条途径。本论文完成了粘虫(Mythimna separate)成虫头部的de novo转录组测序,揭示了粘虫成虫头部的基因表达情况,鉴定了粘虫的生物钟基因、黑色素合成途径相关基因、嗅觉相关的非受体蛋白基因家族。同时,基于转录组测序数据,鉴定了参与柞蚕(Antheraea pernyi)蜕皮激素合成途径的相关基因。粘虫是一种分布广泛、迁飞能力强的重要农业害虫。然而,关于粘虫迁飞的生理上和行为上应激反应的分子调控机制的知识仍所知甚少。本论文进行了粘虫成虫头部的转录组测序。测序共产生了63499个转录本,进一步组装成了46459个unigene(N50为1153 bp),其中有22334个在数据库中具有注释信息。我们发现,在成虫头部的转录组数据中,参与信号转导机制的基因最为丰富,总计有937个信号转导相关基因被注释到22个信号通路中。基于获得的转录组数据,我们鉴定了粘虫的生物钟相关基因、黑色素合成途径相关基因、嗅觉相关的非受体蛋白基因家族。转录组数据揭示了粘虫成虫头部的基因表达情况,同时,这些被注释的基因为今后进一步的功能研究奠定了基础。在昆虫的生长和发育过程中,前胸腺合成和分泌的蜕皮激素起着至关重要的作用,如蜕皮激素可以解除柞蚕蛹的滞育状态。最近,我们实验室发现了咪唑类化合物KK-42可以延迟柞蚕蛹滞育的解除。这两种生理现象的改变均与蜕皮激素合成途径相关。但是,目前我们对柞蚕蜕皮激素合成途径相关基因的了解还很少。因此,基于实验室前期完成的柞蚕前胸腺转录组数据,本论文鉴定了柞蚕前胸腺中参与蜕皮激素合成途径的相关基因,包括Neverland、Spook、Phantom、Disembodied、Shadow。RT-PCR检测结果证实Spook、Phantom、Shadow基因在前胸腺中均表达。这些蜕皮激素合成途径相关基因的鉴定,为进一步开展功能研究奠定了基础。
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