目的:研究新疆博州地区3~5岁汉族、维吾尔族、蒙古族儿童口腔内变形链球菌的检出率,分析不同龋敏感儿童口腔中变形链球菌基因型与儿童龋病间的相关性。方法:从新疆博州地区儿童口腔流行病学调查资料样本库中分层随机抽取90名儿童为研究对象,高龋组(龋失补牙数≥5)及无龋组(龋失补牙数=0)各45人,每组中汉族、维吾尔族、蒙古族儿童各15人,收集牙菌斑样本,用轻唾-杆菌肽琼脂培养基和脑心浸液培养基培养变形链球菌,通过革兰染色,生化鉴定和聚合酶链反应等方法进一步鉴定临床分离株,并通过随机引物聚合酶链式反应检测基因型分布。结果:(1)在90名受检儿童中变形链球菌的检出率为75.5%,高龋组变形链球菌的检出率为86.7%,高于无龋组的64.4%(P=0.014)。汉族、维吾尔族、蒙古族比较时,变形链球菌的检出率差异无统计学意义(P=0.457)。(2)本实验共获得549株变形链球菌临床菌株,发现113种不同的基因型。高龋组中61.5%的个体具有两种及两种以上变形链球菌基因型,无龋组中仅有37.9%的个体具有两种及两种以上的基因型,高龋组的变形链球菌基因多态性高于无龋组,差异具有统计学意义(P=0.035)。(3)趋势卡方检验结果表明,三民族儿童口腔内变形链球菌基因多态性与龋敏感度有线性相关关系(趋势χ~2=4.767,P=0.029)。结论:博州地区儿童口腔内变形链球菌在不同龋敏感组间的分布有差异,在民族间无差异,高龋组群体中存在的变形链球菌比无龋组拥有更多的基因型数量,其基因多态性可能与变形链球菌的致龋能力相关。