耧斗菜(Aquilegia viridiflora)隶属于毛茛科(Ranunculaceae)耧斗菜属(Aquilegia),该属共包括70多个物种,广泛分布于北半球温带地区。我国大概分布有13个耧斗菜属物种,其中耧斗菜是分布比较广泛的物种之一。本实验选取了耧斗菜这个物种内的7个自然居群作为研究对象。这些自然群体广泛分布于我国的东北与华北地区,并在花的形态和颜色方面存在显着差异。为了研究该物种的遗传结构,我们运用了单拷贝核基因标记的方法对耧斗菜这7个自然居群共计100个个体的三个核基因(ADH,OGGA,gEST-8)和十个叶绿体基因(trnD-psbM、matK、ndhJ-trnF ndhC-trnV、Ycf6-psbM、rps12-rp120、atpH-atpL、ndhA、trnC-ycf6和trnC-rpoB)进行遗传结构分析。根据所获得的数据,我们进行了遗传结构(Genetic structure)、单倍型网络支系图(Haplotype network)和系统发育树(Phylogenetic tree)等相关方面的分析。根据遗传多样性结果分析显示,该物种的各个居群都具有较高的遗传多样性(Genetic diversity)。单倍型网络支系结果显示该物种内各居群间的单倍型在各个地区的比例差异并不明显。此外,根据遗传分化分析显示,耧斗菜物种内各居群间出现了一定程度的遗传分化。综合以上所有结果,耧斗菜各居群间的花在形态颜色上已出现了较为显着的差别,同时在遗传水平上也出现了一定程度的分化。基于这些结果,我们初步推断导致该现象产生的原因可能是不同的居群在进化的过程中在地理隔离作用下的遗传漂变以及不同自然环境下的选择压力使它们逐渐产生了表型与遗传分化。