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目的了解中缅边境恶性疟原虫株pfmdr1及pfMSP1基因多态性及分布特点；探究pfmdr1基因是否可以用于分型研究；分析pfMSP1基因多态性与pfmdr1、疟疾临床表现的相关性以及其影响因素。方法Chelex-100提取滤纸血滴恶性疟原虫DNA，巢式PCR方法扩增pfmdr1基因编码蛋白第86氨基酸片段及pfMSP1基因第2区与第3区部分片段，并进一步对其进行DNA测序；对扩增片段基因的结构、同源性进行分析；统计学分析pfMSP1基因多态性同种族、性别、年龄、疟疾病史、原虫血症等影响因素以及与疟疾临床表现的相关性。结果(1)49份样本全部扩增出pfmdr1基因的目的条带，与3D7株比较显示中缅边境恶性疟原虫pfmdr1基因第86位点未发生突变，第25、27、28、29、30位氨基酸均发生基因突变。系统发育树分析得出pfmdr1基因地域指示性不高。(2)47份样本扩增出72个目的条带，以MAD20型为主导型(占63.89％)，K1、RO33型为次之，并存在不同等位基因株混合感染现象。(3)与泰国恶性疟原虫株MAD20亚型（AB276006.1）比较其105、109、116、122、128、132、133、134、135位氨基酸存在不同程度的突变,以T-109为甚,频度分别为95.7%。与泰国恶性疟原虫株K1亚型（AB276007.1）比较见55、56、67、68、69、70、71、72、79、80、81、82、83、84、87、88、89、90、93、95、96、105、138、140、141位氨基酸存在不同程度的突变,以T-87、-88、-89、-90、T-93、G-95、T-96为甚,频度分别为53.33%、53.33%、53.33%、53.33%、60%、53.33%和53.33%。与加纳恶性疟原虫株的RO33亚型(AB276005.1)比较其55、56、57、67、119位氨基酸存在不同程度的突变,以D-55（63.6%）为甚。总之，中缅边境恶性疟原虫pfMSP1基因具有较高的多态性。(5)pfMSP1基因多态性与种族、性别、年龄、疟疾病史、原虫血症不存在相关性，推测可能与野生型pfmdr1、混合亚型感染、地理区域有关。(6) pfMSP1基因亚型单一感染与混合感染的症状无差异。两例中缅边境重症疟患者的血滴标分离出MAD20亚型。结论(1)中缅边境pfmdr1基因具有多态性。（2）初步证实pfmdr1基因地域指示性不高，不适合作为分型基因。(3) pfMSP1存在MAD20型、K1型和RO33型三种等位基因型，以MAD20型为优势虫株，且有疟疾症状者以MAD20型为主，pfMSP1基因的感染复数（MOI）为1.47。(4)中缅边境恶性疟原虫pfMSP1基因存在较高的多态性。