基于纳米金颗粒和无标记核酸探针的SNP检测技术研究

来源 :南华大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:yangbintian
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背景及目的:单核苷酸多态性SNP主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性,是可遗传变异中最常见的突变。SNP遗传稳定性强,数量多,覆盖面广,已经取代限制性片段长度多态和微卫星多态,成为第三代DNA分子标记。人类的SNP通常表现为双等位基因多态性,可分为突变纯合子、正常纯合子和杂合子三种基因型,许多疾病的发生发展与单个碱基的突变密切相关,准确快速地检测SNP基因型,对疾病、临床检测和分子诊断等有重大意义。本研究以β地中海贫血的球蛋白基因的IVS-2-654和CD17这二个点突变作为研究对象,通过纳米金颗粒技术提高不对称PCR扩增特异性得到检测靶序列,运用无标记核酸探针技术,联合连接酶的高保真连接特性,构建一种不同基因型之间有显著熔点差异的单核苷酸多态性SNP的检测方法。  方法:利用纳米金颗粒介导不对称PCR得到检测靶序列,构建一种新的无标记核酸探针,综合连接酶技术和熔点差异扩大技术,通过连接反应介导显著提高不同基因型之间的熔点差异,然后根据不同的熔点峰快速准确地进行 SNP多态性检测和分型。  结果:适宜浓度的纳米金颗粒提高了PCR扩增效率,通过无标记核酸探针,在连接反应过程中,各基因型产生了较大的熔点差异,实现了准确快速地点突变基因型分型,并成功对球蛋白基因的IVS-2-654和CD17这二个点突变的三种基因型进行有效分型。  结论:通过纳米金颗粒介导的不对称PCR扩增,使PCR产量和效率得以提高,获得了高质量的产物。设计了一种新的无标记核酸探针,通过连接酶技术和熔点差异扩大技术,创建了一种无荧光标记的SNP检测与分型的新方法。该方法具有准确、方便、快捷及成本低等特点,具有良好的保真性,有望对遗传病的筛查、预防和基因诊断有一定意义。
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