随着科学技术和经济的迅猛发展，我国提出实施科教兴国和人才强国战略，这就要求高校加快学科建设和科学研究队伍建设的步伐。学科带头人是高校学科建设的领导者与组织者，是基础研究的领军人物，学科带头人绩效的提升一方面有助于基础研究能力的提升，另一方面有助于高校学科的建设，对学科带头人的培养已成为当前普遍关注的问题。从20世纪90年代开始，我国提出一系列人才培养计划，逐步加大对高校学科带头人的选拔和培养的力度。在国家的大力倡导下，各地方政府也加大了对学科带头人的培养力度。国家自然科学基金与地方自然科学基金承担着促进基础研究发展的重任，是学科带头人开展科研活动的最主要资助来源。然而，在对学科带头人进行资助后，其绩效是否得到了很好的提升？国家自然科学基金与地方自然科学基金的资助对学科带头人绩效的影响程度如何？这些有待探讨的问题是本文研究的主要内容。本文以2005年颁布的浙江省省属10所高校的理工科55位重点学科带头人2001-2010年的数据为研究样本。通过建立泊松回归模型，分析基础研究投入对学科带头人绩效的影响。并充分考虑了基础研究成果产出的滞后效应，分别建立零滞后期、滞后一年、滞后两年、滞后三年模型，研究基础研究投入对不同时期学科带头人绩效的影响。通过实证分析本文得出以下几个结论：1）浙江省自然科学基金资助对学科带头人国内论文产出量存在显著正影响，且存在两期的滞后效应；2）浙江省自然科学基金资助对学科带头人SCI论文数、发明专利申请量的影响不显著；3）国家自然科学基金资助对学科带头人国内论文产出量存在显著正影响，且存在一期的滞后效应；4）国家自然科学基金资助对学科带头人SCI论文产出量存在显著正影响，且存在两期的滞后效应；5）国家自然科学基金资助对学科带头人发明专利申请量存在显著正影响，且存在一期的滞后效应；6）随着年龄的增长，学科带头人绩效呈现先升后降的规律；7）学科类别影响学科带头人的绩效；8）学科带头人科研成果产出具有连续性。最后，根据实证分析结果，并结合浙江省的实际情况，从政府、基金委、高校三个层面提出了七点政策建议，以期加强学科带头人的培养。