MDM4单核苷酸多态性与急性髓系白血病相关性研究

来源 :山西医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jht20007
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目的:  1. 研究MDM4基因12个SNPs等位基因及基因型的分布情况。  2. 探讨MDM4基因单核苷酸多态性(SNP)与急性髓系白血病(AML)相关性。  3. 研究MDM4基因单体型与急性髓系白血病(AML)之间的关系。  方法:  1. MDM4基因12个SNPs基因型分布情况与急性髓系白血病发病风险关系  收集192例初发AML患者骨髓或外周血及192例健康体检者外周血样本,分别提取全基因组DNA,将MDM4基因12个多态性位点分别设计相应的引物,经聚合酶链式反应(PCR)扩增,所扩增的产物通过高分辨熔解曲线技术(HRM)对多态性位点分别进行基因型分析;分型后各基因型随机抽取3~5个样本进行PCR扩增,所扩增的产物送生工生物工程进行测序验证HRM分型的准确性,比较各个位点病例组与健康对照组基因型分布有无差异。  2. 检测MDM4基因表达水平  提取20例初发AML患者与10例正常对照组骨髓或外周血样本的总RNA,运用Real Time RT-PCR方法检测MDM4基因mRNA的表达水平,并分析病例组与对照组MDM4表达水平是否具有统计学意义。  3. 采用Haploview软件分析MDM4基因单体型与AML之间的相关性  分别统计192例AML患者与192例健康对照组10个SNPs的基因型,按照Haploview软件格式要求录入数据,对MDM4基因10个SNP位点进行基因单体型及连锁不平衡分析。  结果:  1. MDM4基因12个SNPs中10个位点能顺利进行基因分型,HRM基因分型后各基因型与随机送生工生物工程公司测序结果相符合。MDM4基因rs10900597-G和rs2290854-T等位基因在AML患者中高于健康对照组;与健康对照组相比rs2290854-TT基因型在AML患者中明显升高(P<0.05)。  2. Real Time RT-PCR方法检测MDM4基因mRNA的表达水平,MDM4基因的表达在各基因型中无显著差异。  3. 单体型关联分析结果表明,MDM4基因单体型GCTTGGCGGA在AML中的分布比健康对照组高(P<0.05);单体型ACTTGGTGGA在AML中的分布比健康对照组低(P<0.05),结果具有统计学意义。  结论:  1. MDM4基因 rs10900597-G和 rs2290854-T等位基因在 AML 患者中高于健康对照组;rs2290854-TT 基因型在 AML 患者中明显高于健康对照组。rs2290854-TT可能在AML的发生中起重要作用,可能作为AML易感性的遗传标记。  2. MDM4基因单体型GCTTGGCGGA与AML呈正相关;单体型ACTTGGTGGA与AML呈负相关。
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