论文部分内容阅读
现代家鸡起源于原鸡,但其驯化地、驯化时间及扩散路线等驯化模式问题已经争论了一个多世纪,其争论的主要焦点是做为现代家鸡祖先的红原鸡的野生种目前的栖息地主要集中在亚洲南部地区,而世界上最早的家鸡遗骸却出土于黄河中游地区。要解析家鸡起源驯化模式,必须澄清黄河中游地区的古代遗骸的物种属性及与现代家鸡的遗传关系。通过环介导引物介导的PCR方法,我们对39个鸡骨残骸进行了DNA分析。样本分别来自黄河流域中下游距今约10000年的南庄头遗址、距今约7500年的磁山遗址和距今约4500年的王因遗址,以及长江中游距今约3000年的九连墩战国楚墓遗址。我们还对南庄头遗址、磁山遗址的骨骼样品进行了碳14年代测定。研究结果表明：(1)南庄头遗址的古代样本来自新石器时代早期文化堆积层距今约10500年；磁山遗址的古代样本来自典型的新石器时代磁山文化堆积层距今约7900年；(2)获得了来自以上4个遗址的13个样品的线粒体COI基因159bp序列。通过与鸡形目6个属的196条COI基因同源序列的遗传分析发现古代样本均源于原鸡属群体；(3)获得了来自以上4个遗址的8个样品的线粒体DNA控制区326bp序列,通过与10条发表的古DNA序列和1001条来自4个原鸡种的同源序列的聚类分析,发现现代家鸡的祖先单倍型群类型在距今约一万年的新石器时代黄河流域中游地区的古代群体中就已经存在,揭示出黄河流域的原始种群是现代家鸡的祖先之一,并证明了中国北方地区曾经存在早期家鸡驯化事件；(4)全新世早期以来华北平原地区气候和环境变化巨大,南庄头遗址和磁山遗址出土的大量热带动植物证明全新世早期中国北方的环境适合原鸡生存。最早的粟类栽种及猪、狗驯化说明当时的生产力发展水平足以进行家鸡驯化。新石器时代早期家鸡遗传多样性丰富反映其驯化的早期阶段,揭示出华北地区从南庄头遗址转型农业到磁山遗址成熟农业的逐渐发展过程；(5)亚洲南部地区的原鸡和现代家鸡群体拥有独特的单倍型,综合农业起源证据,认为家鸡是多地区多物种起源,但亚洲南部的家鸡驯化开始时间还有待进一步探寻。本研究建立了适用于古代家鸡考古样本DNA研究的技术平台,首次报道了距今超过4500年的古代家鸡样本DNA序列,并获得了世界上最古老的家鸡样本DNA序列,发现中国北方地区是除南亚东南亚地区之外另一个重要的家鸡起源地,其驯化时间从距今大约10000年的新石器时代早期就已经开始。