浒苔中C3和C4途径关键酶的研究

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2008年6月,黄海海域出现大规模浒苔绿藻,大量浒苔堆积在青岛沿海一线,对青岛近海的旅游景观和海水养殖业造成了巨大破坏。浒苔绿潮的出现正值青岛奥帆赛准备期间,绿潮的成因及其潜在的危害效应得到了国内外的普遍关注。但是,到现在为止,对于浒苔绿潮暴发的原因还没有定论。浒苔能够在短时间内大规模暴发,说明其有非常有效的光合系统,特别是光合碳同化途径。光合作用将无机物转化为有机物,同时固定太阳的光能,是地球上最重要的化学反应。C3植物中C4途径的发现,以及某些C4植物的特定发育阶段进行C3碳同化方式,说明植物的光合碳同化途径具有极大的可塑性。随着新一代测序技术的发展,在一些藻类中发现了与C4途径相关的基因。在全基因组测序的单细胞绿藻Ostreococcus tauri中发现了C4途径中所有的相关基因。通过对海洋硅藻威氏海链藻(Thalassiosira weissflogii)和三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum)的基因组测序,也发现了与C4光合作用相关的基因。在CO2浓度降低时,威氏海链藻(T. weissfogii)的PEPC的活性会增加。通过叶绿素荧光仪Dual-PAM-100测定浒苔在不同条件(干出不同时间、不同盐度、不同光照强度和不同温度)下PSII的最大光化学效率(Fv/Fm)和实际光化学效率Y(Ⅱ)。在干出、高盐60‰、低盐0‰、强光2000μmol m-2s-1、高温35℃等条件下,浒苔的Fv/Fm和Y(Ⅱ)逐渐降低,表明这些条件可以引起浒苔的胁迫响应。特别是在干出和强光条件下,浒苔的Fv/Fm和Y(Ⅱ)降低幅度很大,说明这两个条件可以引起浒苔强烈的胁迫响应。我们采用454测序技术,对浒苔(Ulva prolifera)的转录组进行测序。得到了445,787个高质量的read,占原始序列的88.5%。通过组装,得到了13,426个contig,平均长度为1,000bp。Contigs通过进一步组装,得到10,784个isotig。组装成的Isotigs的平均长度为1,515bp。我们将得到的序列与KEGG数据库进行比较,发现浒苔的固碳途径中含有C3途径和C4途径所需要的几乎所有酶类。根据浒苔转录组测序获得的PPDK基因的部分序列,设计引物,通过PCR扩增得到PPDK基因的部分序列。然后根据PPDK基因的部分序列进行5’-RACE和3’-RACE反应,最终得到了PPDK基因cDNA全长序列。该序列全长为3114bp,开放阅读框(ORF)长度为2700bp,编码899个氨基酸残基,等电点为5.60,相对分子质量为96.43KDa,在NCBI上的登录号为JN936854。根据浒苔的PPDK氨基酸序列建立的系统进化树可以看出,在高等植物和藻类中同时存在C3、C3-C4和C4物种,说明C4途径的出现是一种多源独立进化。通过实时荧光定量PCR法对浒苔中C3途径和C4途径关键酶基因rbcL和PPDK的研究发现,在浒苔受到一些非生物胁迫时rbcL和PPDK基因表达量都会升高,但是PPDK基因表达量升高的幅度更大。然后采用分光光度法分别测量浒苔在不同环境条件下C3途径和C4途径关键酶的活性,在任何环境条件下,浒苔Rubisco和PPDK都有酶活性,而且浒苔Rubisco的酶活性始终都高于PPDK,在浒苔受到一定的非生物胁迫时,C3和C4途径的酶活性会升高,但是超出浒苔的耐受范围,酶活性会降低。研究表明在浒苔中,可能同时存在C3和C4途径,并且以C3途径为主。
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