随着知识经济时代到来，人类社会的发展比以往的任何时代都更加依赖科学技术的进步，科技的发展无疑己经成为社会发展的核心动力。科技创新主体企业化是发达国家推进科技进步的一个行之有效的方法。高新技术企业作为科技创新主体代表，对于优化国家产业结构、转变经济发展方式、推动国家经济发展具有带动和辐射作用。为了促进高新技术企的发展，我国制定并实施了一系列的优惠政策和发展规划。进过多年努力，我国企业研发投入持续提高，但与发达国家相比仍处于较低的水平。公司治理结构不完善被众多学者认为是制约企业研发活动的主要因素之一。企业研发投入受外部环境因素和内部治理结构因素两方面的影响，外部因素最终还是通过影响企业的内部各要素来间接产生作用的，企业内部因素应该是影响研发投入的主要因素。而公司治理机制正是影响和调节企业内部股东、董事会、管理层之间利益冲突的一种制度框架。那么，公司治理框架下的公司的股东、董事会、管理层甚至监事会是如何影响企业的研发投入的？因此，本文从公司治理结构的角度出发，研究公司治理对企业研发投入的影响。首先，本文阐述了研究背景，研究意义，并对相关文献进行了梳理总结。发现多数研究从公司治理的某一方面，如董事会结构、股权结构等入手，少有从公司治理角度的系统性研究，所得结论也并不一致，且很少针对高新技术产业这一特定行业进行的实证研究，其研究结论也难免会受到行业差异性的影响。其次，本文运用委托代理理论、激励理论、及技术创新相关理论分析了公司治理结构各因素（包括股权结构、董事会结构、管理层结构及监事会结构四分方面）对研发投入的影响，并提出研究假设。第三，本文根据研究假设对各变量进行定义，并设计了研究模型，随后以沪、深两市2010年1月1日前上市，被认定为高新技术企业且公布了研发支出的上市公司作为研究样本，选取样本企业2010年至2012年的有关数据进行分析。本文首先对各变量进行了全样本和分组样本描述性统计，对研究样本进行了初步分析；然后选取相关指标，采用多元回归模型对公司治理结构、研发投入强度的关系进行了相关性和回归检验，分析了各变量之间的关系。最后，本文研究发现：国有股权不利于企业研发活动的开展，这就要求我国进一步加大国有企业改革力度，明晰产权责任，增强国有企业活；企业研发投入与股权集中度呈先上升、后下降、再上升、最后下降的M型，并且发现大股东持股超过三分之一即可带来绝对控股的正效应，而非传统上认定的50%绝对控股比例，并且过高的持股比例反而会导致大股东因无法分散风险减少研发活动的开展；大股东间的股权制衡有利于研发活动的开展；董事会规模与研发投入强度负相关；董事会独立性与研发投入强度正相关，独立董事能够促进研发活动的开展；高管处股比例与研发投入强度正相关，说明股权激励是有效的；董事长与总经理两职兼任有利于研发投入的增加；监事会规模与企业研发投入正相关，但没通过显著性检验；监事会成员持股有利于研发活动的开展。