随着企业内部控制发展日益成熟,行政事业单位内部控制建设也成为政府以及社会关注的热点问题。自从2012年12月,财政部印发了《行政事业单位内部控制规范(试行)》开始,越来越多完善行政事业单位内部控制与风险管理的文件出台。为了防止各单位内部控制建设流于内控制度形式,政府决定采用以量化评价为导向,对内部控制的完善程度进行系统评估,通过“以评带建”提升各单位的重视程度。在中央统一领导、各级各区分级管控的形势下,相关文件的引领下,各单位响应号召,自我审查单位制度存在的漏洞,由于没有具体要素条框规范,不论在单位层面还是业务层面仍存在一些问题亟待解决。基于目前行政事业单位内部控制现状,本文借助大数据、云计算等计算机技术革命,辅助建立基于云会计的完善行政事业单位内部控制框架结构。2020年已经到来,离国家富强、民族复兴、人民幸福的中国梦又近了一步,结合新技术进行风险管理和内部控制创新是适应新时代经济转型的需要。云会计的出现,是会计行业的巨大变革,带来了新兴的机遇和挑战。行政事业单位的业务活动可以基于云会计提高处理速度和效率,大量的业务数据和财务数据在“云端”进行共享,然后通过手机、平板和电脑等终端,可以很方便地对会计业务进行处理。行政事业单位管理人员实时通过财务、非财务信息融合进行挖掘分析,对六大业务的风险进行系统、全面地识别和评估,对单位的业务流程进行梳理、监控以及反馈到上级领导决策,更好的为行政事业单位内部管理提供支持。本文首先阐述了行政事业单位内部控制和云会计的相关理论,并分析了当前行政事业单位内部控制的现状与困境,提出了基于云会计的行政事业单位内部控制在单位层面和业务层面的优化思路。接着根据项目调研对A市海事局的内控案例进行分析,对内部控制进行数据收集以及流程图描述,然后将基于云会计的行政事业单位内部控制优化思路落实到到A市海事局的内部控制实况,通过对案例的具体剖析和方案设计,最终提出基于云会计的行政事业单位内部控制优化措施,为我国行政事业单位内部控制发展提供理论依据和案例支撑。