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背景和目的:肠易激综合征(irritable bowel syndrome, IBS)在消化科门诊较多见。据报道人群发病率高达10%,其发病机制不明确。近年来有学者报道线粒体基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)可能与功能性胃肠病(functional gastrointestinal disease,FGID)相关,因而线粒体基因在IBS中的作用受到关注。D-loop区是线粒体基因的突变好发区域,特别是高变Ⅰ区和高变Ⅱ区。以前的研究表明D-loop区的SNPs与肿瘤、不孕症和溃疡性结肠炎等疾病的发生或预后有关,但与IBS的关系报道较少。本课题旨在研究腹泻型IBS (IBS with diarrhea; IBS-D)和便秘型 IBS (IBS with constipation; IBS-C)患者的肠道线粒体基因D-loop区的SNPs,通过和对照组比较筛选与IBS相关的SNP位点。方法:本研究纳入受试对象40例,其中IBS-D20例,IBS-C10例和健康查体者10例。全部IBS患者均符合罗马Ⅲ中相应的诊断标准。所有受试对象均行电子结肠镜检查并于退镜时在乙状结肠活检,活检标本用常规方法提取基因组DNA,用特异性引物对线粒体D-loop区行聚合酶链式反应及测序,然后和GenBank标准序列(NC-012920)比对,并与人类线粒体基因组SNP标准数据库MITOMAP( www.mitomap.org)进行比较,分析并筛选出SNP位点。结果:1.IBS-D组、IBS-C组和对照组在性别组成、年龄和BMI均无统计学差异;2.三组D-loop区共发现108个SNP位点,变异类型包括碱基置换(base replacement)、插入(insertion)和缺失(deletion),主要是碱基置换(92.6%)。SNP位点主要集中在高变区(Ⅰ和Ⅱ),但三组SNP位点在高变区的分布无显著差异(P=0.234)。我们还发现有17个SNP位点在三组中均出现,44个SNP位点只出现在IBS-D组;3. IBS-D组、IBS-C组和对照组D-loop区的SNPs数目为12.2±2.7、9.8±1.8和9.9±2.1,IBS-D组高于IBS-C组和对照组(P分别为0.018、0.026),IBS-C组和对照组无显著差异(P=0.91); 4.对全部SNP位点逐个分析,发现只有199位点在两组有差异,基因型199C的频率在对照组显著高于IBS-D组(P=0.03),而IBS-C组和对照组无统计学差异。结论:IBS-D患者肠道黏膜线粒体D-loop区SNPs数量显著增多,可能在IBS-D发病机制中有一定的作用:IBS-C和IBS-D的SNPs数目有显著性差异提示两种IBS亚型中线粒体基因D-loop区所起作用可能不同;199位点的多态性也许和可能与IBS-D发病风险有关,基因型199C可能会降低IBS-D的患病风险。