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对采自内蒙古中西部7个地区的5种针叶树油松、樟子松、云杉、杜松、落叶松进行了内生真菌的分离、鉴定及物种多样性分析;并对其优势菌株进行了生理特性的研究和内生真菌拮抗菌的筛选,结果表明:1.从5种针叶树中共分离出内生真菌1810株(未产孢583株),分属51属。其中从油松中共分离出内生真菌490株,樟子松中分离出404株,云杉中分离出359株,杜松中分离出345株,落叶松中分离出212株。链格孢属(Alternaria sp.)和青霉属(Penicillium sp.)是5种针叶树的优势菌属,分别占分离总株数的21.93%和17.02%。2.从针叶树叶柄中分离到内生真菌最多为465株,果实中最少为256株;树冠各层次内生真菌种群和数量为上层<中层<下层;不同树龄的内生真菌种类和数量也呈现一定的规律性:1～5a生<5～10a生<10～20a生<20～30a生<30～40a生;在多样性分析中,呼和浩特市油松的多样性指数最高,小井沟落叶松多样性指数最低。3.对针叶树内生真菌优势菌链格孢属和青霉属的生物学特性研究表明:链格孢属的最适温度为30℃,青霉属为25℃;链格孢属以葡萄糖为主要碳源,青霉属以蔗糖为主要碳源,两种菌均以蛋白胨为主要氮源;对最佳培养基的研究表明,链格孢属的生长受氮源的影响较大,而青霉属受碳源的影响较大;两属菌丝体干质量与培养基质量浓度和糖质量浓度均呈正相关。4.综合两点对峙培养和孢子萌发试验的结果可以看出针叶树中的4种内生菌及其代谢产物对病原菌的生长均有较好的拮抗作用。青霉属菌株对丝核菌属(Rhizoctonia sp.)、金黄壳囊孢菌(Cytospora chrysosperma)和炭疽菌属(Colletotrichum sp.)的抑制显著(P<0.05),抑菌率分别为67.96%, 65.91%和61.12%;盾壳霉属(Coniothyrium sp.)菌株对镰孢菌属(Fusarium sp.)的抑制率最高(P<0.05),为76.38%。