SF3B1/Hsh155p高频突变导致RNA剪接紊乱的分子机制研究

来源 :中国科学院大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:regrgdgdgg
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
大部分真核生物基因的转录产物RNA前体(pre-RNA)均需在后续的加工过程中通过RNA剪接(RNA splicing)精确地移除其中的内含子,才能形成成熟的RNA(包括mRNA和一些非编码RNA)。RNA剪接是真核生物基因表达调控过程中的关键步骤,它与细胞分化、器官发育、病理过程等密切相关。  尽管RNA剪接只包括两步转酯化学反应,但是负责其催化的剪接体(Spliceosome)却是一个复杂而又动态的大分子RNA-蛋白质复合物。在剪接体的组装与催化过程中涉及到由5种小分子核RNA(small nuclear RNA,snRNA)组成的小核糖核蛋白复合物(small nuclear RNPs,snRNPs)及大量蛋白因子的参与。随着剪接体的有序组装,RNA前体中的重要剪接元件可被精确地识别,从而使内含子得以界定并被有效地移除。在这一过程中,各类snRNP和相关蛋白的不断加入或解离,会导致剪接体的构象持续地发生变化,因此会在不同的组装阶段形成多种中间体复合物,如早期复合物E、预剪接体复合物(Complex A)、复合物B、Bact、C等。研究表明,这些中间体复合物的形成和构像变化是由多个ATP水解酶(又称RNA解旋酶)来推动发生的。  近年来,日渐普及的全外显子组测序技术揭示了多种剪接体早期组装的关键因子在各类肿瘤细胞中的多位点高频突变。如在骨髓发育异常综合征和慢性淋巴性白血病患者的肿瘤细胞中,剪接因子SF3B1的突变频率分别达到75.3%和9.7%,这些突变大部分都集中在其C端的HEAT motif上。人源SF3B1及其酵母同源蛋白Hsh155p的C端区域均含有22个HEAT motifs,且其氨基酸序列具有极高的同源性。SF3B1是SF3B蛋白复合物中最大的亚基,也是U2snRNP的重要组分,它在预剪接体复合物中结合于分支位点腺嘌呤的两侧,但在剪接后期会从复合物中解离下来,以使第一步转酯反应得以顺利发生。在肿瘤细胞中,SF3B1的突变能够导致特定基因的剪接模式发生变化,但其改变RNA剪接的分子作用机制至今尚不清楚。  为了回答这一问题,本论文利用酵母的遗传学操作优势和实验室全套内含子突变体报告基因检测系统的便利,深入解析了SF3B1在血液病肿瘤细胞中的高频突变改变RNA剪接的具体分子作用机制,并取得了以下研究结果:  (1)利用铜离子报告基因检测系统发现,这些SF3B1高频突变所对应的芽殖酵母(S.cerevisiae)hsh155突变体只能特异性地改变剪接支点区域的保真性,而对内含子其它区域的保真性调控并无影响。这一特征与ATP水解酶Prp5p的突变体表型极为相似。  (2)通过体外蛋白质互作实验证明,Hsh155p能够直接结合Prp5p,且两者之间的相互作用是通过Hsh155p蛋白的两个HEATs区域(HEATs1-6与9-12)和Prp5p蛋白的N1-205区域来介导实现的。由于血液病肿瘤细胞中的SF3B1高频突变位点多数集中在其HEATs4-9的区域内,因此暗示这些突变可能会改变SF3B1与Prp5p的相互作用,进而影响RNA的剪接。  (3)肿瘤来源的SF3B1高频突变和我们在HEATs区域额外筛选的其它突变均能够显著地改变Hsh155p与Prp5p在体外及体内的相互作用,并且其互作强度的变化与相应突变体对剪接支点区域保真性的影响有着显著的相关性。  (4)进一步的突变体研究结果表明,增强Hsh155p与Prp5p之间的直接相互作用,有利于促进预剪接体复合物的形成,进而加速了Prp5p的后续解离;反之,减弱两者之间的相互作用,会阻碍预剪接体复合物的形成,从而抑制了Prp5p的解离。  由此可见,本论文利用芽殖酵母系统,从剪接体组装机制的角度揭示出血液病肿瘤细胞中的一些SF3B1高频突变能够通过改变其与ATP水解酶Prp5p的相互作用,而影响剪接体对剪接支点序列的选择,进而导致特定基因的RNA剪接发生变化。这一研究成果不仅进一步完善了剪接体早期阶段的组装模型,还为探究相关疾病的发生机制提供了有利线索。
其他文献
目前,数字档案馆所依附的档案服务部门,无论是各级各类国家档案馆,还是企业单位的档案工作机构,其工作相对稳定,竞争压力小,普遍缺乏竞争意识。显然,这种状况十分不利于数字
脱毒种薯分为原原种、原种、一级原种和二级原种,以此类推。一级原种种植5~6年后由于留种保种不严格,会再感染以致退化。目前社会上有人用一般种薯冒充脱毒种薯招摇撞骗,薯农
精子染色质重塑(Sperm Chromatin Remodeling)是正常受精形成合子及胚胎正常发育所必需的事件。这一过程使高度致密的无转录活性的染色质重塑成为非致密的具有转录活性的染色
理论性与实践性相结合:评估指标体系设计、指标选取、指标标准及数据采集方法等应符合科学研究规律,同时又能对事实状况进行客观准确地反映。整体性与细节性相结合:指标体系
近来越来越多的研究表明,端粒酶不仅可以维持端粒的长度,调节细胞衰老的进程,而且在细胞凋亡,DNA损伤修复和基因转录调控等方面具有独立于端粒酶活性之外的新功能。端粒酶新
1.创建电子文件管理流程示范模式。要确定全程管理的思想,并将该思想应用于电子文件管理流程中。要推行示范性的电子文件管理流程,确保电子文件管理的最终目标是为了长久地保
1997年,煤炭工业认真贯彻江泽民总书记、李鹏总理等中央领导同志关于安全工作的重要指示精神,抓住贯彻实施《煤炭法》、整顿煤炭生产秩序的有利时机,以突出防治重大特大瓦斯、煤
自2012年,为细菌提供获得性免疫防御的CRISPR/Cas9系统,被改造成RNA引导靶向基因组的核酸内切酶工具,用于编辑哺乳动物的基因组;并且通过向单细胞期的胚胎共注射Cas9mRNA和sgRNA
井冈山位于湘赣边界的罗霄山脉中段,山势高大,主峰为五指峰,海拔1586米。这里山高林密,地势险峻,有大小峰峦500余座,最高峰2120米,很多座山峰都在海拔1000米以上。1927年秋,
油松人工林是北京山区乃至华北地区主要的森林类型,对固碳减排、改善北京的生态环境起着举足轻重的作用,而抚育间伐是人工林结构优化、提高碳汇能力的重要手段。所以,探讨抚育间