人膀胱移行细胞癌基因表达谱变化的研究

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膀胱肿瘤是我国泌尿生殖系统最常见的肿瘤,移行细胞癌是最常见的病理类型,其最主要的临床特点是复发率高。随着分子遗传学,免疫学,生物化学及分子生物学的迅速发展,人们对肿瘤发生发展过程中的细胞和分子水平的变化有了更深刻全面的认识。近年来肿瘤研究工作者进行了大量有关癌基因激活,抑癌基因缺失,杂合性缺失,微卫星DNA不稳定在膀胱肿瘤发生发展中的作用研究,试图探讨肿瘤发生的分子和细胞机制。虽然已经获得了大量有价值的实验证据,但肿瘤发生发展的许多环节尚不能用单一的分子或基因变化来解释,肿瘤的发生和发展涉及复杂的,多步骤的及多种基因的参与过程,这一观点已为肿瘤研究工作者所共识。二十世纪九十年代发展起来且日益成熟的一门崭新的生物技术即基因芯片,为高通量,大规模地在基因水平研究肿瘤的发生发展提供了有力的手段,使分子生物学时代正在转变为“基因组生物学时代”。通过一次芯片杂交实验就可以观察到成千上万的目的基因或基因片段的表达变化,使人们真正脱离了传统的一次实验只能孤立地研究一个或几个基因的时代。本实验利用基因表达谱芯片,以正常膀胱粘膜组织为对照,分别对原发及复发膀胱移行细胞癌(TCC)组织的基因表达谱进行研究,寻找TCC组织与正常膀胱粘膜组织的基因表达差异,并利用半定量RT-PCR对原发/复发TCC组织中呈相反变化的部分基因进行了验证,以探讨基因表达谱变化与膀胱肿瘤发生发展的关系。 实验的主要结果如下: 1 以正常膀胱粘膜组织为对照,原发TCC组织的基因表达谱变化中,有229条基因的表达呈明显上调,170条基因的表达呈明显下调,差异表达的基因种类有:原癌基因和抑癌基因,细胞信号转导,细胞周期,细胞调节蛋白,细胞凋亡相关蛋白,DNA合成、修复和重组蛋白,DNA结合、转录和转录因子,细胞受体,细胞表面抗原和粘附蛋白,离子通道和运输蛋白,代谢类等。 2以正常膀肤粘膜组织为对照,复发TCC组织的基因表达谱变化中,有175条基因的表达呈明显上调,168条基因的表达呈明显下调,差异表达的基因功能涉及原癌基因和抑癌基导因,细胞信号转,细胞周期,细胞调节蛋白,细胞凋亡相关蛋白,DNA合成、修复和重组蛋白,DNA结合、转录和转录因子,细胞受体,细胞表面抗原和粘附蛋白,离子通道和运输蛋白,代谢类等。 3原发和复发TCC组织中共同表达的差异基因有189条,其中共同上调的基因有102条,下调的基因有87条,差异表达的基因功能涉及原癌基因和抑癌基因,细胞信号转导,细胞周期,细胞调节蛋白,细胞凋亡相关蛋白,DNA合成、修复和重组蛋白,DNA结合、转录和转录因子,细胞受体,细胞表面抗原和粘附蛋白,离子通道和运输蛋白,代谢类等。 4原发和复发TCC组织中,有15条基因的表达呈现相反的变化,即在原发TCC组织中上调而在复发TCC组织中下调的基因有11条,在原发TCC组织中下调而在复发TCC组织中上调的基因有4条,这些基因的功能涉及细胞信号转导(AL023584,AJ010046,AF231124,NM一004576,NM一006096),细胞周期蛋白(u47414,X62o4s),免疫(AFo43los,U97519),代谢(U05861,M14636,M94856),离子通道和运输蛋白(U05861),DNA合成、修复、重组蛋白(U72649),DNA结合、转录和转录因子 (NM一001182)等。 5半定量RT一PCR随机对其中的涉及细胞信号转导及细胞周期的6条基因进行了验证,其结果与基因芯片的结果基本一致,说明基因芯片不仅具有高通量和高度敏感的优点,而且结果准确可信,同时进一步证明这巧条呈相反变化的基因可能与TCC复发有密切的联系。 6本实验的研究结果充分体现了基因芯片技术能够低消耗,高度敏感,高通量地分析肿瘤组织基因表达谱的特点。通过对大量膀肤癌与正常膀肤粘膜组织之间差异表达基因的比较分析,发现了许多新的差异表达的膀肤癌相关基因,通过对原发TCC与复发TCC基因表达差异的分析,寻找TCC复发相关基因,使我们从全新的视角对膀胧癌发生发展的分子机理进行认识,从而对膀肤癌的研究提供新的思路与线索。
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