随着我国改革的推进,城镇一体化建设也不断加强。近几年,国家明确指出要增强农村发展活力,逐步缩小城乡差距,促进城乡共同繁荣。在城乡一体化中,“三农”基础设施建设需要大量的资本投入和全方位的资金服务。新型农村金融机构作为农村金融体系中的新生力量,其在促进农业与其他产业合作、农村与城市联动发展等方面发挥着巨大作用。政府决策是国家管理公共事务,也是保障国家整体安全稳定的一项基本职能。本研究基于政府对农村金融机构风险识别和决策管理的角度,识别出农村金融机构的风险类别,并对政府制定风险管理的决策程序进行研究,分析政府在农村金融机构风险管理决策中存在的问题。研究发现我国政府决策的体系机制还不完善,缺乏科学化和民主化。应当建立清晰地价值规范和决策目标;构建独立、自律的监督体系;健全决策评估和反馈机制。同时也对改善政府决策环境提出政策建议,提升对农村金融机构风险管理效率。