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目的:明确新疆KS感染HHV-8的K1亚型和K15等位基因型,并初步探讨新疆KS不同临床分型及临床表现与不同HHV-8亚型的相关性。方法:使用酚-氯仿-异戊醇法对新疆维吾尔自治区人民医院收集的27例KS石蜡包埋组织进行HHV-8 DNA抽提,并使用巢式PCR扩增K15基因片段并测序,确定K15等位基因型;同时使用巢式PCR扩增K1基因片段并测序,利用Clustal W程序对根据DNASTAR软件翻译出的K1位点氨基酸序列进行序列比对,根据比对结果运用PHYLIP软件包对K1位点进行系统发生学分析,确定HHV-8K1亚型;最后运用Fisher确切概率法对结果进行统计学分析处理。结果:(1)27例新疆KS中有22例HHV-8感染为阳性,阳性率为81.50%,其中4例AIDS-KS患者HHV-8感染均为阳性,感染率100%;(2)基于K1基因位点系统进化树分析发现,18例为K1-C亚型(其中15例为C2,2例为C3,另1例不能明确其分支),4例为K1-A型(其中1例为A1,另3例不能明确其分支);基于K15位点,20例为P基因型,2例为M基因型;(3)新疆HHV-8各病毒株K1氨基酸序列(121aa,包括VR1及其附近序列)间的差异性为0～23.31%,A和C亚型病毒株K1氨基酸序列间差异性为7.58%～23.31%(平均差异性14.86%);(4)新疆4例AIDS-KS患者感染的HHV-8亚型分别为K1-A1、C2和C3,并且均为K15 P等位基因型,而仅有的2例K15 M等位基因型HHV-8感染者均为经典型KS患者;(5)不同HHV-8 K1亚型之间KS患者粘膜损害有显著差异性(P<0.05),A亚型HHV-8感染者粘膜损害率明显高于比C亚型感染者(分别为75%和11.11%,P<0.05);(6)新疆经典型KS和AIDS-KS患者之间不同HHV-8 K1亚型或K15等位基因型感染率的差异性无统计学意义(P >0.05)。结论:(1)新疆KS患者感染的HHV-8亚型主要属于K1-C亚型和K15 P等位基因型,并且以C2/P嵌合型为主,也存在部分的K1-A亚型和K15 M等位基因型感染者,其中A亚型和K15等位基因型为国内首次报道;(2)A亚型比C亚型HHV-8对粘膜更具有侵袭性;(3)新疆KS患者感染的不同HHV-8 K1亚型以及K15等位基因型与KS临床类型之间均无明显的相关性。