河流是连接陆地与海洋物质循环和能量流动的重要桥梁，研究河流食物网结构及其影响因素对于理解河流生物多样性特征具有重要意义。碳源作为驱动食物网的基础能量来源，可决定食物网的结构组成与营养关系。新疆是我国西北地区水生生物多样性较高的地区，该地区河流、湖泊、水库的水生生物资源丰富，然而相关的研究甚少，尤其缺乏对于食物网的系统性研究。额尔齐斯河是新疆第二大河流，也是我国唯一一条流入北冰洋的跨境河流，它不仅具有丰富的水资源，而且也是新疆水生生态环境保持较为原始的区域之一。本研究在2013年5月、7月、9月对额尔齐斯河干流及其附属水体的基础食物源进行系统调查，并结合水体理化因子，分析食物资源的可利用性;应用稳定同位素技术构建不同水文期及不同河段的食物网结构，利用贝叶斯混合模型计算不同食物源对河流水体消费者的贡献率，从资源可利用性和水文变化两方面分析额尔齐斯河食物网营养结构及其碳源利用的变化趋势。主要研究结论如下:　　1、系统调查了额尔齐斯河周丛藻类、浮游植物、浮游动物和大型底栖动物密度和生物量。其中周丛藻类的年平均密度为914.19×106cell/m2，年平均生物量为1383.02mg/m2，其密度和生物量在不同月份之间均存在极显著差异(p＜0.01);浮游植物的年平均密度与生物量分别为0.40×106cell/L和0.62mg/L;浮游动物的年平均生物量为0.060mg/L，在不同河段间存在显著差异(p＜0.05);大型底栖动物的年平均生物量为6.24g/m2，不同河段之间存在极显著差异(p＜0.01)。　　2、基础食物源与环境因子的Pearson相关性分析表明:额尔齐斯河周丛藻类的密度与总氮呈显著的正相关(p＜0.05)，其生物量与电导率、TDS、总氮呈显著的正相关(p＜0.05)，与盐度呈极显著的正相关(p＜0.01);浮游植物的密度与氨氮呈显著的正相关(p＜0.05)，其生物量与氨氮呈显著的正相关(p＜0.05)，与水温呈极显著的正相关(p＜0.01)，与流速呈极显著的负相关(p＜0.01);浮游动物的生物量与氨氮呈显著的正相关(p＜0.05);大型底栖动物的生物量与水温呈显著的负相关(p＜0.05)，与透明度呈极显著的正相关(p＜0.01)。　　3、基于稳定同位素技术描述了额尔齐斯河食物网的时空变化特征，结果表明:5月、7月、9月δ13C值变化范围分别为-31.99‰～-14.95‰、-29.11‰～-14.82‰和-28.22‰～-15.07‰;δ15N值变化范围分别为4.07‰～13.04‰、1.54‰～10.73‰和1.34‰～11.16‰。5月的δ13C范围更广，δ15N值更为富集。空间上，上游δ13C值变化范围为-28.01‰～-14.95‰，δ15N值变化范围为1.61‰～11.17‰;中游δ13C值变化范围为-29.37‰～-15.07‰，δ15N值变化范围为2.09‰～10.55‰;下游δ13C值变化范围为-28.76‰～-15.18‰，δ15N值变化范围为1.34‰～10.41‰。上游食物链更长，且绝大部分鱼类的营养级高于下游的营养级。额尔齐斯河可利用的食物源包括五类:周丛藻类、水生植物、POM、陆生树叶和河岸植物。它们的平均δ13C值和δ15N值分别为-22.62‰和4.45‰、-14.95‰和4.83‰、-24.55‰和4.99‰、-28.43‰和1.99‰、-26.78‰和8.37‰，这五种食物源碳、氮同位素值均存在显著差异（Kruskal-Wallis，p＜0.01）。　　4、运用贝叶斯混合模型计算额尔齐斯河不同季节及不同河段五种食物源对水体消费者（鱼类与水体无脊椎动物）的贡献率，结果表明:陆生树叶是水生无脊椎动物各个水文时期最主要的食物来源;鱼类的食物源贡献率存在季节变化，5月最主要的食物来源是水生植物，而7月、9月最主要的食物来源是河岸植物。空间上，陆生树叶是上游和下游水生无脊椎动物最主要的食物来源，中游则是河岸植物;上游鱼类最主要的食物来源是水生植物，而中下游是河岸植物。　　5、将五种食物源按照来源划分为内源碳和外源碳，结果表明外源碳是水生无脊椎动物各个水文时期最主要的碳源，内源碳是5月鱼类的主要碳源，外源碳是7月、9月鱼类主要的碳源;空间上，外源碳是水生无脊椎动物主要的碳源，内源碳是上游鱼类的主要的碳源，外源碳是中下游鱼类主要的碳源。