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杂种优势的充分利用是提高大豆产量的一条有效的途径。质核互作雄性不育性的恢复性遗传研究对于杂种优势的利用具有重要意义。近年来，随着分子标记技术的快速发展，利用分子标记进行基因定位已成为当前育性相关基因研究的重要方法。在众多的分子标记类型中，SSR标记以其操作简便、费用低廉、重复性高、稳定性好以及共显性好等优点，被广泛地用于基因定位研究。
大豆质核互作雄性不育系NJCMS1A是以组合N8855×N2899F1不育株为母本，以N2899为父本，连续多代回交选育而成的，N2899为其同型保持系。本试验拟对大豆质核互作雄性不育系NJCMS1A开展育性恢复性遗传和育性恢复基因的SSR标记定位研究。主要结果如下:
利用组合NJCMS1A×南农19-15的F1、F2、F2∶3对大豆质核互作雄性不育系NJCMS1A的育性恢复性遗传进行研究。研究结果表明NJCMS1A的育性恢复性遗传在不同年份间表现稳定，F1全部表现为可育，F2表现出育性分离，可育株与不育株的分离比例经测验符合3∶1，F2∶3中无育性分离的家系数:分离比例符合3∶1的家系数经x2测验符合1∶2，说明在组合NJCMS1A×南农19-15中NJCMS1A的育性恢复性由一对显性基因控制。
随机选取组合NJCMS1A×南农19-15的720个F2单株作为SSR分子标记定位群体，采用923对大豆SSR引物对亲本进行标记多态性筛选，有332对引物在亲本间表现有多态性。用该332对SSR引物对不育基因池（S池）和可育基因池（F池）进行筛选，结果14对SSR引物表现有多态性。然后用这14对引物对NJCMS1A、南农19-15、S池和F池进行筛选，有7对引物表现有多态性。最后用这7对引物，对NJCMS1A、南农19-15、S池、F池、F1和F2进行扩增，结果发现有5对标记表现为共显性，其中Satt398、Satt152和sat_238经x2测验表现为1∶2∶1的分离，另2个标记Satt430和Sat_216表现为偏分离。通过MAPMAKER/EXP3.0软件进行连锁分析，结果发现Satt152与NJCMS1A育性恢复基因连锁，最后将恢复基因定位于N连锁群的Sat_084和Sat_208之间，距离两标记的遗传距离分别为1.2cM和1.7cM。