目前，我国正处于突发公共事件高发期，国内相继爆发了一些社会影响重大、危害后果严重的突发公共事件，由于这些事件爆发突然、蔓延迅速、影响广泛，处置是否及时妥当，直接关系到社会稳定和国家安危，是对政府工作的一个重要考验。国家审计作为保证国家经济社会健康运行的“免疫系统”，在政府开展突发公共事件应对工作时，揭露和查处重大违法和违规问题,及时跟进、密切关注救援资金和物资的安全及政府应对工作中存在的薄弱环节和潜在风险,密切关注经济问题可能引发的社会不稳定因素,及时提出对策性建议,防范苗头性问题演变成趋势性问题、局部性问题演变成全局性问题，以提高政府应对工作的效率。因此，对突发公共事件国家审计问题进行研究不仅具有一定的理论价值，而且也具有比较重要的现实意义。本文围绕政府应对突发公共事件中国家审计存在的问题，首先分析了突发公共事件的特点、突发公共事件的特点对国家审计的影响以及突发公共事件国家审计的特点。其次，研究了当前我国突发公共事件国家审计存在的现实问题，主要以突发公共事件国家审计存在法律、制度缺陷；缺乏系统的应急审计预案；突发公共事件财务审计需完善；全面开展突发公共事件绩效审计存在障碍；参与审计的审计人员综合素质欠缺五方面为重点内容展开论述，分别揭示了当前我国突发公共事件国家审计存在问题的现状。最后，文章从突发公共事件国家审计面临问题的原因着手，有针对性地提出了解决问题的一些可行性对策，以配合政府部门高质、高效地完成突发公共事件应对工作。