担子菌毛头鬼伞的TMV抗性蛋白y3基因的分离、鉴定和表达

来源 :西北大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiaokexiaoai1314
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
许多具有生物活性的蛋白质具有潜在的应用价值,因而吸引着人们的研究兴趣。目前已被纯化和鉴定的真菌蛋白质有:核糖体失活蛋白、抗真菌蛋白、类-泛素蛋白、免疫调节蛋白、漆酶、凝集素、抗病毒蛋白,以及其他酶类:纤维素酶木聚糖酶、转化酶、核糖核酸酶等。对毛头鬼伞(Coprinus comatus (Mull.:Fr.) S. F. Gray)生物活性蛋白研究较深入的当属毛头鬼伞抗性蛋白Y3。该蛋白具有抗植物病毒TMV的活性、红细胞凝集活性,也与核糖体失活蛋白(RIP)有所相似。抗性蛋白Y3作为一种新的蛋白资源,有希望开发成转基因的抗病毒工程产品用于生物农药生产。为了达到此目的,首先需要获得抗蛋白基因y3的全长序列,并鉴定该基因抗病毒特性。鉴于毛头鬼伞的抗性蛋白Y3具有潜在的应用价值和开发前景,本文分离了抗性蛋白y3基因,并分析了它的结构与功能。取得的主要结果如下:(1)用YADE法从毛头鬼伞菌丝体中分离了抗性蛋白基因y3的全长DNA序列,发现其由1289 bp核苷酸组成(GenBank Accession No. HM204931),包括5L侧翼和3L侧翼区。(2)用5’-RACE从毛头鬼伞菌丝体中克隆出y3基因的全长cDNA序列,该全长序列由534个bp组成,含1个ORF,编码130个氨基酸残基。GenBank和EMBL中索引号(Accession No.)分别为GQ859168和FN546262。(3)y3基因的DNA和cDNA比对表明, y3基因含5个外显子和4个内含子。本研究获得的抗性蛋白基因y3的全长序列与前人报道的研究结果之间,有101个氨基酸残基共享序列。全长序列推导的氨基酸序列比原先增加了29个氨基酸残基。依据本研究的实验数据,使用在线网络启动子预测系统,发现了抗性蛋白基因y3的转录起始位点A和TATA盒,为进一步研究该基因的生物学功能奠定了基础。(4)本研究得到的cDNA全长序列和由此推导的氨基酸序列与前人发表的基因y3的部分对应片断都表现出了高度的相似性,相似率达94%。利用y3基因全长序列信息,克隆了y3基因cDNA序列,并用它与pBI121和pCAMBIA1301构建了植物表达载体pCAMBIA1301-y3。(5)用pCAMBIA1301-y3转化烟草,获得了转基因植株。经PCR, RT-PCR和Northern blot分析证实,y3基因已经整合到烟草基因组中,并在其中得到表达。对TMV的抗性鉴定也表明,y3基因导入使转基因烟草植株表现出一定抗病毒活性。y3基因全长序列的获得和对烟草的成功转化为y3基因的进一步研究奠定了基础。(6)对前人关于真菌核酸的快速提取方法做了改进,用于真菌和烟草DNA和RNA的提取。同时,通过低温保藏试验评价核酸提取液和提取产物的稳定性和有效性;利用凝胶电泳、PCR和RT-PCR等方法比较分析核酸质量;并将提取效果与传统方法或试剂盒的提取效果进行比较。结果表明,改进后的提取方法是一种简单、方便和有效的实验方法,不仅可用于真菌也可用于植物DNA和RNA提取,用这种方法提取得到的DNA和RNA在低温保存条件下比较稳定,能较长时间保持其原有活性。(7)在从毛头鬼伞中克隆抗性蛋白基因y3时意外获得的一条非目的条带,长度为906 bp (GenBank Accession No. GU568178)。将此序列通过NCBI的BLAST搜索,以及与其同源序列进行Clustal w和MEGA4.1聚类分析,证实该序列是28S rRNA。同时还发现毛头鬼伞的系统进化关系比较离散。此外,在这一新28S rRNA与TMV的抗性蛋白基因y3之间发现有两个同源区段有可能是PCR扩增y3基因时出现非目的条带的原因。在这两个同源区段中,其一与克隆y3基因时所用的PCR引物之一有较高的相似性,另一区段也是一般PCR引物的类似物。本研究中新28S rRNA序列的获得是PCR扩增中出现非目的条带的新例,这一新序列的发现及聚类分析的结果有助于该真菌基因组学及真菌生物分子分类系统的建立。
其他文献
近年来,环境压力严峻能源资源也非常短缺,新能源汽车凭借着自身的优势,逐渐成为国家重要的战略布局,也为国家的经济发展带来了崭新的机遇。一直以来,我国都大力推广新能源汽
文学的现实性与超越性是文学理论领域的一个重要课题,是一个关系到文学本体论的问题.本文试图对文学的现实性与超越性作一粗浅探讨,指出文学需要超越,但超越是建立在现实基础
完善的财会内控机制有利于保障企业资金的安全性、会计信息的有效性和企业的经济效益性,对企业的生存和发展有着十分重要的作用。在社会经济的快速发展下,企业间的竞争演变得
本文分析了基于我国房屋产权制度的变更而出现的城市社区业主委员会在社区的日常管理中与社区管理的另外两股主要力量——物业公司和居委会的利益博弈关系,分析论证了业主委
<正>党的十八大是在我国进入全面建成小康社会决定性阶段召开的一次十分重要的大会,是一次高举旗帜、继往开来、团结奋进的大会,对凝聚党心军心民心、推动党和国家事业发展具
会议
目的:探讨可溶性ST2(sST2 )对急性失代偿心力衰竭(ADHF)伴肾功能不全患者短期预后的预测价值,为sST2 在ADHF伴肾功能不全患者中的应用提供客观依据。方法:选取2015年8月~2016
这里的所谓反译法,是指英语中有些从正面表达的词或句子,汉语译文可以从反面来表达;英语中有些从反面表达的词或句子,汉语译文可以从正面来表达。即英语中有些否定句,汉语可译成肯
随着我国道路运输事业迅猛发展,水泥路面作为主要路面铺装结构类型之一,已于公路、城市道路、港口道路和机场跑道中广泛应用。以接缝式水泥路面为主,采用嵌缝材料对接缝进行
研究了线性阻尼结构振动系统的模态综合技术,在线性阻尼结构振动系统实变换进行方程解耦的还原变换的基础上,构造了线性阻尼结构振动系统的固定界面模态综合方法.这一方法克
融资期限结构是信用债券市场融资效率的重要体现。与美国相比,中国信用债市场期限偏短,并且两国债券市场期限差异近年来不断扩大。导致中美信用债券市场期限差异化的原因:一