论文部分内容阅读
背景遗传性视网膜疾病(Inherited Retinal Disease,IRD)临床上以视野和视力等视功能严重受损为主要特征,又叫原发性视网膜变性或视网膜营养不良,可以分为单纯性的视网膜疾病和综合征性的视网膜疾病。视网膜色素变性(RP)是IRD中发病率占据首位的单基因遗传病,是常见的致盲性眼病之一。IRD主要的特点是具有高度的临床异质性和遗传异质性,因此准确的分子诊断对于临床确诊是非常有帮助的。通过基于高通量测序的目标区域捕获技术进行准确的分子诊断,是目前最为流行和高性价比的方法。本研究的目的是利用这种基于高通量测序的目标区域捕获技术,检测三个常染色体隐性遗传视网膜疾病家系的致病突变。方法利用向罗氏nimblegen公司定制的一个捕获283个眼科遗传病相关基因(包括165个视网膜病已知致病基因)外显子的液相芯片,结合下一代高通量测序,检测3个临床初诊为视网膜色素变性的家系先证者样本,经信息分析提取样本变异,以及解读分析,查找样本的致病基因和突变。并利用sanger测序技术进行家系验证。结果在三个家系先证者样本经测序分析后,得到平均350X以上的测序深度,和超过92%的目标区域获得最少20X覆盖度的测序数据。三个先证者分别发现在三个基因:RDH5、CEP290和NMNAT1基因上,发现可疑致病突变,这些突变经sanger测序进行了家系验证。然而突变基因所提示疾病与临床初诊不符,经临床复核其中两个先证者发现,一个患者临床诊断改为与分子诊断相符的白点状眼底,另一个患者则诊断为RP合并白内障。结论本研究在三个临床初诊为RP的AR遗传家系中发现了候选致病突变,三个家系分子诊断与临床初诊不符,后经临床复核,一个家系临床诊断修改为与分子诊断相符的疾病。该病例的分子诊断提示临床误诊,最后辅助临床准确诊断的结果,揭示了基于下一代高通量测序的捕获技术的基因检测对于遗传性疾病,尤其是具有高度临床异质性和遗传异质性遗传病的临床诊断和分子诊断的重要性和先进性。