现代生物技术是人类科技发展的优秀成果，运用现代生物技术促进社会发展是人类从必然王国迈向自由王国的理性选择。在二十一世纪，现代生物技术知识产权将成为世界各国在经济一体化、贸易全球化、信息对称化背景下新一轮竞争的制高点。当前在现代生物技术的知识产权保护和农业现代化应用等方面存在严重的理论不足与实践缺失。农业是我国的第一产业，是我国国民经济立足和迅速发展的前提和基础。现代生物技术具有全球性、专业性、国家利益性等天然特点，在国际农业产业竞争已达白热化的现实状况下，如何通过现代生物技术知识产权保护提升我国的农业竞争力，是我们面临的一个重大课题。在现代农业建设的广阔背景下，通过现代生物技术改造和提升传统农业使之现代化，是提升我国农业竞争力的必然途径。提升我国农业竞争力是我国现代生物技术知识产权保护的重要目标，加强我国现代生物技术知识产权保护与提升我国农业竞争力是水乳交融、密不可分的。现代生物技术知识产权最密切的实施产业是农业，最广阔的市场是农村，最大的受益者是处于社会弱势地位的农民。只有以提升农业竞争力为目标，才能使我国的现代农业建设和现代生物技术知识产权保护具备明确的方向和内容。同样，也只有我国的农业竞争力获得大幅度提升，我国的现代农业建设和现代生物技术知识产权保护才能获得迅速发展的驱动力。知识产权制度通过赋予权利人适度的垄断来实现智力成果社会效益的最大化，这一特点使得知识产权制度成为促进科技发展、推广科技创新最有效的制度手段之一。在法律视野下，由于现代生物技术知识产权保护涉及个人利益、社会利益、国家利益等可能相互冲突的法益，因此在加强现代生物技术知识产权保护、提升我国农业竞争力立法中确立法益衡平的理念是极为必要和重要的。除此之外，利益的导向性也是相关立法需要考量的一个重大问题。因为只有通过有效的知识产权保护，才能够促进现代生物技术的迅速发展和成熟，才能够切实保护作为弱势群体的农民的根本利益，才能够在国际贸易中进一步增强我国的农业竞争力，最终促进我国综合国力的迅速提高和农业的可持续发展。以消除关税壁垒、实现国民待遇、促进全球经济一体化为目的的WTO对知识产权保护极为重视。WTO立法框架将现代生物技术知识产权保护纳入其中，通过知识产权保护手段促进现代生物技术的迅速发展，并通过对知识产权的权利限制、绿色壁垒等手段对现代生物技术可能造成的影响进行规制。在全球经济一体化的背景下，作为发展中国家的我国应当如何通过法律手段加强我国现代生物技术知识产权保护、切实提升我国农业竞争力，应当如何在维护本国利益的基础上维护发展中国家的整体利益，均是应当进行认真探讨的内容。本研究立足法益衡平、市场化、国家适度干预等知识产权保护的基本原则，以提升农业竞争力为研究目标，立足我国现实状况进行了深入的理论探讨与现实解读，并在理念重构、策略选择、国家战略和立法实践上提出了相当的可行性建议，对加强现代生物技术知识产权保护、提升农业竞争力和促进现代农业建设具有一定理论价值与现实指导作用。