面对当今世界科技迅猛发展的形势，作为开展基础性研究、技术创新研究和培养高层次人才的大学国家重点实验室，不仅要跟上我国科技体制改革的步伐，还要适应现代化科技交叉、渗透、联合和整体发展的趋势，从而进一步发挥大学国家重点实验室“开放、流动、联合、竞争”的功能和作用，提高现代化管理水平及管理效率。22年来一批优秀的大学国家重点实验室已成为我国基础研究和应用基础研究领域中的国家队，为我国科技发展做出了重要贡献，但由于现有条件和体制的限制，大学国家重点实验室的管理模式及运行机制现状仍令人担忧。本课题正是在这样的背景下展开研究的。整个研究共分成五个部分：第一部分：导言。界定大学国家重点实验室、管理模式、运行机制、创新等概念，描述了大学国家重点实验室管理模式及运行机制的现状，介绍了本研究的内容与方法，并阐述了国内对上述问题的相关论述。第二部分：我国大学国家重点实验室管理体制研究。分析了大学国家重点实验室的发展情况、特点、性质，剖析了我国大学国家重点实验室的管理体制和管理层次。第三部分：我国大学国家重点实验室运行机制研究。阐述了大学国家重点实验室运行机制的内涵，优势和缺陷。第四部分：我国大学国家重点实验室管理模式及运行机制的比较研究和实证研究。阐述了美国和英国重点实验室管理模式及运行机制的实际情况，通过我国大学国家重点实验室管理模式及运行机制的比较研究和案例分析，说明我国大学国家重点实验室管理模式及运行机制的构建必要性。第五部分：我国大学国家重点实验室管理模式及运行机制创新研究。在上述研究的基础上，论文提出了构建我国大学国家重点实验室管理模式及运行机制的基本原则，构建了我国大学国家重点实验室新的管理模式，创新了我国大学国家重点实验室运行机制，并对加强大学国家重点实验室管理模式及运行机制提出了建议与措施。