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随着水产养殖业养殖规模的不断扩大,养殖模式的不断改革,与此而来的鱼类病害问题也日益突出和严重,尤其是由病毒引起的大规模暴发性传染病更是给水产养殖业带来了沉重的打击,每年由此造成的损失非常惊人,严重危害了水产养殖业的健康发展。干扰素具有广谱的抗病毒作用,在治疗一些人类病毒病时取得了良好的效果。实践证明运用体外表达的重组干扰素不会对宿主和环境产生危害,因此利用广谱的抗病基因进行鱼类疾病防治可能最有发展前途。
自20世纪70年代中期首例cDNA克隆问世以来,构建cDNA文库已成为研究功能基因组学的基本手段之一。可以从cDNA文库中筛选到所需的目的基因,并直接用于该目的基因的表达。通过构建cDNA表达文库不仅可保护濒危珍惜生物资源,而且可以提供构建分子标记连锁图谱的所用探针,更重要的是可以用于分离全长基因进而开展基因功能研究。因此,cDNA在研究具体某类特定细胞中基因组的表达状态及表达基因的功能鉴定方便具有特殊的优势,从而使它在个体发育、细胞分化、细胞周期调控、细胞衰老和死亡:调控等生命现象的研究中具有更为广泛的应用价值,是研究工作中最常使用到的基因文库。
构建诱导后的草鱼cDNA文库,可以大量获得免疫基因,对于研究草鱼的非特异性免疫和与之相关的干扰素系统有很大的帮助。
方法:用Poly I:C注射草鱼,诱导其表达大量的免疫基因。然后提取RNA,用加了HA接头的Oligo(dT)做引物,引导cDNA第一链的合成,并在加完双链EcoR I接头后进行cDNA双链的PCR扩增,得到了cDNA PCR Library。然后将加了EcoR I接头的cDNA连接到用EcDR I内切酶处理过的质粒载体里,构建了PolyI:C诱导后的草鱼cDNA文库。随后设计引物在该文库中对Zα cDNA片段和干扰素cDNA进行筛选。
结果:构建的cDNA PCR Library的大小平均在1.5kb左右,达到建库的基本要求,而且经免疫基因检验完整性较好。克隆得到的Zα cDNA片段大小在480bp左右,与CaPKR-like基因进行比对,发现在Zα区域同源性非常高,初步鉴定的IFN基因片段大小在400bp左右,与预期的一致。证明该文库构建较为成功。