近年来，农民专业合作社的内部运行机制日益规范，发展的外部环境条件也不断改善。但随着《合作社法》的颁布实施，对农民专业合作社的发展提出了新的要求，这既是机遇也是挑战。因此，特别需要从整体上和实证上研究农民专业合作社的运营和管理问题。本研究从实证的角度对农民专业合作社的运营绩效进行研究，探讨影响农民专业合作社营运绩效的影响因素，并通过定量分析方法进行深入分析，提出农民专业合作社绩效评价方法并揭示农民专业合作社运营绩效的影响因素，从而为提升农民专业合作社营运绩效提供思路和路径，也有助于农民专业合作社的进一步发展和壮大。本文通过对沙县103个农民专业合作社进行问卷调查及访谈，描述其发展现状和问题，并对沙县农民专业合作社的运营绩效及其影响因素进行理论分析和实证研究，得到以下基本结论：①对沙县103家农民专业合作社调查显示，农民专业合作社的整体运营效率普遍不高，大多数农民专业合作社盈利返还机制不明晰；组织结构、内部制度不完善，管理不规范；规模偏小，经济实力不强；效益低，盈利能力差；市场适应力差，竞争力弱；带动农户力度与吸纳就业人数有限；发展具有区域局限；社区文化建设不强；②建立了包括11个指标的基于营运规模、营运过程和营运结果评价的农民专业合作社营运绩效评价指标体系。应用因子分析和主成分分析法对沙县10家较规范的农民专业合作社的绩效进行实证评价；③基于制度经济学理论和合作经济组织理论及委托代理理论分析了影响农民专业合作社营运效率的影响因子，在此基础上，基于沙县农民专业合作社的调查数据运用Logistic回归模型对农民专业合作社营运效率的影响因素进行实证研究；④基于研究提出了加大政府扶持，扩大经营范围和规模，加大引进人才力度，加强农产品要素市场建设，广开融资渠道，完善合作社运营机制等六点提升农民专业合作社营运绩效的对策建议。全文共分八章，第一章为绪论，主要是研究方案的设计，提出研究思路和可能的创新之处；第二章为本研究的主要理论基础，在界定相关概念的基础上，分析制度经济学理论、合作组织理论、委托代理理论、交易成本理论、绩效评价理论等在专业合作社绩效研究中的运用；第三章是沙县农民专业合作营运绩效的调查分析，通过调查对沙县农民专业合作社的营运绩效和发展现状进行描述性分析；第四章是沙县农民专业合作社运营绩效的评价的实证分析，本章在建立农民专业合作社绩效评价指标体系的基础上，主要通过因子分析法和主成分分析法对沙县农民专业合作社的运营绩效进行评价和分析；第五章是农民专业合作社运营绩效影响因素的理论分析，主要运用前述的理论对可能影响农民专业合作社运营绩效的因素进行分析；第六章是沙县农民专业合作社运营绩效影响因素实证分析，主要是在前述理论分析的基础上，应用多元回归方法对影响沙县农民专业合作运营绩效的因子进行筛选和分析；第七章是提升农民专业合作社运营效率的对策建议，主要是在对影响因子分析的基础上，提出针对性的对策建议；第八章是研究总结和进一步研究的方向。