2003年国务院做出了建立新型农村合作医疗制度的决定,各地相继开始了试点探索。福建省自2004年7月开始新型农村合作医疗试点工作。政府部门和科研工作者从不同的侧面进行了调查研究和评价,这对于决策部门全面掌握信息、完善政策起了重要的作用。但是,绩效综合评价指标体系,既应该有普遍性又应该有特殊性,已有的研究成果不能很好的满足各地的实际情况。鉴于此,本研究从建立新型农村合作医疗的目的出发,以系统论为指导,参考绩效评价的最新理论与实践,结合世界卫生组织关于卫生系统绩效的观点,融会世界银行学院关于卫生服务体系评价的思想,针对新型农村合作医疗现状与发展趋势,充分考虑福建省的实践特点,以查阅文献和专家咨询相结合,建立了比较实用的新型农村合作医疗绩效评价指标体系。建立的绩效评价指标体系包含29项可操作性四级评价指标,以指数的形式来描述,并且用结构、过程、结果3类二级指标对综合绩效进行评价。结构性指标分为组织建设和规章制度2类三级指标,共包括9项可操作性评价指标;过程性指标分为基金筹集、宣传发动和监督管理3类三级指标,共包括8项可操作性评价指标;结果性指标分为基金支付、制度利用和认知意愿3类三级指标,共包括12项可操作性评价指标。以专家咨询的方式获取指导建议,确定指标权重。为了验证评价指标体系,并使评价与实际工作相结合,本研究对福建省试点满一年的9个县(市、区)进行了数据采集,采用一般统计描述、相关分析、回归分析、离散趋势、聚类分析等方法进行分析和验证。结果显示,建立的新型农村合作医疗绩效评价指标体系,各级指标独立性较好,代表性较强,综合评价指数区分度较好。正态分布的综合指数可以根据不同评价目的分类。评价指标参考标准值可以根据不同的评价目的设定,可以根据各级指标实现目标的程度追溯原因。9个试点县(市、区)工作存在较大的差异,有待于继续完善。