在对新疆加工番茄里格87-5进行RNA测序时，我们发现存在南方番茄病毒（Southerntomatovirus，STV）的基因组序列，序列包含STV除5’末端12bp和3’末端35bp的其它全部3390bp的RNA，其中只有5个碱基存在差异（与EF442780相比），说明新疆加工番茄里格87-5感染了STV。STV是一种新发现的双链RNA病毒。该病毒严格种传，不能通过摩擦、嫁接或虫媒传播。为了快速检测加工番茄品种的病毒感染情况，我们设计了STV特异性的PCR引物STV168F/STV745R，用一步法RT-PCR，从里格87-5的总RNA中扩增得到了预期的577bp的扩增产物，经测序证明，该片段是STV特异性的。运用一步法RT-PCR检测方法，我们对新疆石河子蔬菜花卉研究所的部分加工番茄育种材料和田间番茄样本进行了STV带毒情况的检测。每个育种材料检测6~10株，结果全部植株带毒的材料有3份，所有植株均不带毒的有13份，另有4份材料部分植株带毒。检测田间随机抽取的番茄样品165份，检出率为39%。随机选取3个RT-PCR产物进行测序，结果与已报道的STV分离物的序列相似性为99％~100%。说明检测方法是可靠的。为了检验花粉传毒的可能性，我们用带毒植株向不带毒植株授粉，结果F1代种子的病毒检出率为87%。说明STV可以通过花粉传播。