姜氏菌属菌株全基因组测序及比较基因组学分析

来源 :昆明理工大学 | 被引量 : 4次 | 上传用户:hhrs918
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姜氏菌属(Jiangella)隶属于放线菌门放线纲姜氏菌目姜氏菌科,是一类好氧、革兰氏阳性、高G+C含量的微生物类群。姜氏菌属菌株广泛分布于自然界中,其生存环境复杂多样,具有很强的环境适应性。本研究利用二代Hiseq 2000测序平台,对姜氏菌属3株未测序菌株(Jiangella alkaliphila KCTC 19222T, Jiangella alba YIM 61503T, Jiangella muralis DSM 45357T)进行全基因组测序,并结合已发表的姜氏菌基因组序列(Jiangella gansuensis YIM 002T)进行基因组及比较基因组分析,对姜氏菌基因差异和环境适应相关机理进行研究。四株姜氏菌基因组大小在5.59M到7.66M之间,G+C含量均在73%左右,其包含的基因主要涉及能量生产与转换,氨基酸转移与代谢,次级代谢产物的合成、转运和代谢,无机盐离子转运与代谢等。通过对4株姜氏菌属菌株基因组研究表明:姜氏菌属菌株具有强大的代谢能力,能够较好的适应多变的环境;庞大的转运蛋白系统承担着信号交换、营养物质吸收等一系列重要的生理活动;丰富的次级代谢产物基因簇可能有助于提高姜氏菌在环境中的生存竞争和自我防御能力。姜氏菌属菌株上的这些特征使得它们可以较好的响应环境的变化,在自然界中扮演不可或缺的角色。
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