随着我国经济的快速发展，中小企业作为国民经济的重要支柱，对经济的发展和社会的进步扮演者越来越重要的角色。而中小企业经营效益的好坏直接受其内部控制制度实施效果的影响，内部控制的健全发展将提高中小企业的核心竞争力，内部控制的薄弱将削弱企业的竞争力。我国中小企业现行对内部控制制度没得到足够的重视，有些企业没有内部控制制度，有内部控制的企业也是侧重企业财物方面的控制，注重货币资本的监管，对人力资源的控制薄弱，在人力资本控制方面更是缺乏研究。知识经济时代，企业之间的竞争主要体现在人才的竞争上，高素质高质量的人才能为企业带来新的发展机遇和动力，企业能够充满信心的应对各种风险和挑战，故而人力资本的重要性日渐显露出来。因此，在内部控制中加强人力资本控制，将人力资本作为内部控制的对象越来越必要，人力资本控制制度的实施也将是对内部控制制度的进一步补充和完善，进而提高中小企业的核心竞争力。本文通过对中小企业内部控制及人力资本的相关理论进行论述，阐述了内部控制的相关内容及内部控制的重要性，通过分析我国中小企业内部控制的现状，得出我国中小企业内部控制中重视财物的控制和监管，对人员的质量和素质重视程度不够，人员流动性大，积极性差，人力资本的重要性没有发挥出来，即重视货币资本的控制，忽视人力资本的控制，据此将人力资本控制作为内部控制的控制对象，提出了内部控制中进行人力资本控制的必要性，并依照人力资本的特性设计人力资本控制模型，在参照人力资本量的测算方法的基础上对企业人力资本的供给需求量进行计算，根据企业发展目标运用回归分析法预测人力资本的需求供给量，根据人力资本的流向、流量、流速这些关键控制点，依据不相容职务相互分离控制、授权批准控制、预算控制、绩效考评控制等控制措施对人力资本控制模型加以完善，同时以流程图的形式表现出来，最后以M企业为例进行分析研究，运用定性与定量相结合的方法对该企业的内部人力资本控制进行完善。通过研究为中小企业的内部控制提供借鉴意义，进而促进我国中小企业的更快更好发展。